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  • 2018-11-11 发布于福建
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利用SRAP分子标记技术剖析茄子遗传多样性.doc

利用SRAP分子标记技术剖析茄子遗传多样性

利用SRAP分子标记技术剖析茄子遗传多样性   摘 要 利用SRAP技术对36份茄子栽培种进行遗传多样性分析。结果表明:22对引物对36份茄子DNA进行PCR扩增,经过染色后共获得292条多态性条带,平均每个引物组合扩增出13.27条多态性条带。36份茄子品种间遗传相似系数在0.568~0.870,平均遗传相似系数为0.757,这表明该群体的遗传背景相对狭窄。利用UPGMA法对36份茄子资源进行聚类分析,结果显示,在相似系数为0.690处,可将36份茄子资源划分为5个组。   关键词 茄子 ; SRAP ;遗传多样性   分类号 S641.1 Doi:10.12008/j.issn.1009-2196.2016.03.005   Abstract The genetic diversity of 36 eggplant was analyzed by SRAP maker. Two hundred-ninety-two polymorphic bands were amplified by 22 SRAP primers with an average of 13.27 polymorphic bands per primer pair.The genetic similarity was from 0.568 to 0.870 with an average genetic similarity w 0.757. The result suggested that the genetic diversity of 36 eggplants was related narrow. Thirty-six eggplants were clustered into 5 groups at 0.690 coefficients by UPGMA method.   Keywords eggplant ; SRAP ; genetic diversity   茄子(Solanum melongena L.)是世界范围内重要的蔬菜,也是中国冬季重要的南菜北运蔬菜之一。根据海南省统计局统计,2014年海南省茄子产量达到247 974 t,为第六大冬季瓜菜品种。茄子具有显著的杂种优势[1],开展茄子种质分类研究,对茄子杂种优势的利用具有重要意义。与传统的形态学分类相比,利用分子标记对资源进行分类具有不受环境条件影响、重复性好等优点[2]。本课题组前期收集了128份茄子种质资源,并对其中部分资源进行了田间农艺性状调查[3-4],在此基础上,本研究利用SRAP分子标记对其中的36份茄子种资质源的遗传多样性进行分析,为利用杂种优势培育新品种奠定基础。   1 材料与方法   1.1 材料   本试验所需的36份供试材料收集于全国各地,其中32份为商品种,4份为福建地方品种(表1)。于2014年秋季将36份材料种植于中国热带农业科学院南亚热带作物研究所蔬菜基地,采用常规管理。茄子农艺性状的调查参照李锡香等[5]的方法。   1.2 方法   1.2.1 DNA提取   利用康为世纪植物DNA基因组提取试剂盒提取叶片DNA,提取的DNA经1.0%电泳检测,合格后稀释成50 ng/μL备用。   1.2.2 SRAP体系及银染   引物序列参照李怀志等[6]和管志坤[7]的方法,引物由上海生工生物工程有限公司合成。SRAP-PCR反应体系参照李怀志等[6]的方法。反应总体积为10 μL,其中MgCl2 2.0 mmol/L,dNTP各为0.2 mmol/L,引物0.50 μmol/L,模板DNA 50 ng,Taq酶1 U。扩增程序如下:94℃预变性3 min;94℃变性1 min,35℃复性1 min,72℃延伸1 min,5个循环;94℃变性1 min,55℃复性1 min,72℃延伸2 min,35个循环;72℃延伸10 min。扩增产物加7 μL上样缓冲液,94℃变性5 min。采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶,0.5×TBE缓冲液,60 W恒功率电泳1.5 h,银染检测电泳结果。   1.2.3 引物筛选   利用形态差异较大的4份茄子品种(优秀9号、快圆茄、泰国长茄和E208)DNA作为模板,筛选出条带清晰、多态性好的引物,然后有对所有茄子材料进行SRAP-PCR分析。   1.3 数据统计与分析   根据染色结果记录清晰可重复的条带,将电泳图谱清晰且可重复的条带记录为1,同一位置上的弱带或者未出现的记录为0,利用NTSYS 2.10e软件中的UPGMA法进行系统聚类分析。   2 结果与分析   2.1 SRAP引物的筛选及多态性分析   不同引物对扩增条带的数量、清晰等差异较大。对李怀志等[6]和管

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