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- 2018-11-16 发布于福建
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斑马鱼TNFR2基因克隆及表达剖析
斑马鱼TNFR2基因克隆及表达剖析
摘要:利用巢式PCR方法克隆斑马鱼(Danio rerio)肿瘤坏死因子受体2(TNFR2)基因,该基因全长1 242 bp,编码413个氨基酸,分子质量44.68 ku,等电点5.90。实时荧光定量PCR结果表明,TNFR2基因在斑马鱼胚胎发育时期的表达量呈现下降后趋于稳定,在斑马鱼不同组织中均能检测到,并且表达丰度差别不大,在肌肉中表达量最高,在肠道中表达量最低。
关键词:斑马鱼(Danio rerio);肿瘤坏死因子受体2;实时荧光定量PCR
中图分类号:Q786 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2013)17-4171-04
Cloning and Expressing Analysis of TNFR2 Gene of Zebrafish
QI Lin1,YU Ying-cai2,XIANG Zhi-ming3,LI Jun4
(1.Railway Police College, Zhengzhou 450053, China; 2.Department of Biochemistry,Jiangxi University of Traditional Chinese Medicine, Nanchang 330004, China; 3.South China Sea Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Guangzhou 510301, China;
4.School of Pharmaceutical, Liaocheng University, Liaocheng 252000, Shandong, China)
Abstract: Tumor necrosis factor receptor2(TNFR2) of zebrafish was isolated using nest PCR method. The gene was 1 242 bp,encoding 413 amino acids. The deduced molocular mass and pI was 44.68 ku and 5.90 respectively. The realtime qPCR results showed that TNFR2 gene was in“descent-stabilization” pattern during the development period. TNFR2 gene was expressed in different tissues of zebrafish, and highly expressed in muscle, lowly expressed in gut.
Key words: zebrafish(Danio rerio); TNFR2; realtime qPCR
收稿日期:2013-02-18
基金项目:公安部科技创新项目(2012YYCXTDGZ139)。
作者简介:齐 麟(1981-),男,河南开封人,副教授,博士,主要从事分子生物学研究,(电话电子信箱)qilin@;
通讯作者,李 军,(电子信箱)think.a@163.com。
肿瘤坏死因子超家族(Tumor necrosis factor super family,TNFSF)是机体免疫反应的重要调节因子,调控炎症反应、细胞凋亡等诸多细胞应答进程[1]。肿瘤坏死因子(Tumor necrosis factor,TNF)是一类具有多种生物效应的细胞因子,自从1983年发现第一个TNF家族成员TNFα[2],研究者已经鉴定了约20个肿瘤坏死因子。TNF通过与TNFR(TNFR1和TNFR2)结合而发挥了相应的生物学功能[3]。TNFR1和TNFR2都是Ⅰ型跨膜糖蛋白,在胞膜外存在约由40个氨基酸残基组成的富含半胱氨酸的结构域(Cystein rich domain,CRD)[4]。TNFR1在绝大多数细胞中表达,而TNFR2则主要在上皮细胞中表达[5]。TNFR1主要通过募集FADD和TRADD等分子传递信号[6],而TNFR2则通过与TRAF家族结合传递信号[7],最终都是激活NF-κB信号通路[8]。本研究通过巢式PCR方法克隆获得了斑马鱼(Danio rerio)TNFR2基因全长,并对其序列进行生物信息学进化分析。同时,通过实时荧光定量PCR(Realtime qPCR)对斑马鱼TNFR2基因在各个组织及受精后胚胎中进行表达谱分析,为后续研究奠定了基础。
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