高密度小麦遗传连锁图谱构建及产量相关性状QTL定位-作物遗传育种专业论文.docxVIP

山东农业大学博士学位论文 高密度小麦遗传连锁图谱构建及产量相关性状 QTL 定位  PAGE 5  PAGE 4 中 文 摘 要 小麦 (Triticum aestivum L.) 是世界上重要的粮食作物之一。普通小麦是异源六倍体 (2n=6x=42)，含有 A、B 和 D 3 个染色体组，基因组巨大，而且其中含有 80%以上的 DNA 重复序列，导致遗传标记在不同材料间的多态性较差，小麦的遗传研究落后于玉米、水 稻等作物。构建高密度小麦分子标记遗传连锁图，对控制产量相关性状 QTL 进行精细 定位，明确其在染色体上的位置和效应，对于小麦产量相关性状的遗传改良具有重要意 义。本研究利用 3 个关联性作图群体进行高密度遗传连锁图谱的构建，并进行产量相关 性状的多元条件和非条件 QTL 分析，进而在 QTL 水平揭示产量及产量相关性状的遗传 特点。 本研究获得以下主要结果： ⑴ 利用 485 个潍济（WJ）RIL 家系和 229 个潍烟（WY）RIL 家系进行基于 PCR 原理的分子标记遗传连锁图谱的构建，最终获得分别包含 344 和 358 个位点的分子标记 遗传连锁图谱，它们分别覆盖基因组 2855.51 cM 和 3010.72 cM，标记间的平均距离分 别为 8.30 cM 与 8.41 cM。由于相邻标记间距大于 50.0 cM，潍济与潍烟连锁图谱分别各 形成 6 个连锁断点。两图谱共包含 69 个公共位点。 ⑵ 从潍济和潍烟两个群体中分别随机选择 175 和 172 个家系进行基于多样性微阵 列技术(Diversity Arrays Technology)的 DArT 标记的开发，结合 DArT 标记数据及 PCR 分子标记数据，进行遗传连锁图谱的加密，最终获得分别包含 629 和 681 个位点的潍济 与潍烟加密连锁图谱，两图谱分别包含 373 和 406 个 DArT 标记位点，图谱全长分别为 2777.54 cM 和 3004.62 cM，相邻标记间平均距离分别为 4.42 cM 和 4.41 cM。由于相邻 标记间距大于 50.0 cM，潍济与潍烟连锁加密图谱分别形成 8 个和 13 个连锁断点。两图 谱共包含 270 个公共位点。 ⑶ 将潍济与潍烟构建的两个加密图谱与另一基于 179 个家系潍麦 8 号与洛旱 2 号的 F8:9 RIL 家系构建的加密图谱进行整合，最终获得包含 1113 个位点的高密度整合图谱， 其中，536 个是基于 PCR 原理的分子标记位点，575 个为 DArT 标记位点。整合图谱全 长 2946.98 cM，标记间平均距离为 2.65 cM。在 1113 个位点中，群体间共同位点共 494 个，覆盖小麦基因组 1607.21 cM，被用于基于巢式关联作图群体的 QTL 联合分析。 ⑷ 基于全部 485/229 个潍济/潍烟 RIL 家系的 QTL 分析共检测到 533 个控制 21 个 产量及相关性状的加性 QTL；其中，117 个 QTL 在 E1、E2、E3、E4 中被至少重复检  测到 2 次， 36 个 QTL 贡献率超过 10%，为环境间稳定表达的主效 QTL，其中的 19 个 QTL 位于 1B、1D、2A、2B、2D、5A、5D 或 6D 染色体的同一区段，表现为一因多效， 共涉及 7 个控制产量相关性状稳定表达的 QTL 富集区。基于 175/172 个随机选择潍济/ 潍烟 RIL 家系的 QTL 分析共检测到 480 个控制上述 21 个产量相关性状的加性 QTL，其 中 75 个 QTL 在 E1、E2、E3、E4 中被至少重复检测到 2 次，61 个 QTL 贡献率超过 10%， 为环境间稳定表达的主效 QTL，其中的 32 个 QTL 位于 1A、1D、2A、2B、2D、3A、 4A、5A、5B、6A、6B、7B 或 7D 染色体的同一区段，表现为一因多效，共涉及 13 个 控制产量相关性状稳定表达的 QTL 富集区。基于潍济与潍烟群体大群体检测到的 QTL 中，分别有 22.22%和 32.62%的 QTL 在基于小群体 QTL 分析中也被检测到。基于巢式 关联作图群体的 QTL 联合分析共检测到 185 个控制上述 21 个产量相关性状的群体间等 效 QTL。 ⑸ 基于全部 485/229 个潍济/潍烟 RIL 家系的原因/结果条件 QTL 分析，首次揭示了 籽粒大小与千粒重之间，千粒重、穗部性状与穗粒重之间以及穗长、各节间长与株高之 间在单个 QTL 水平之间的关系。籽粒大小与千粒重之间条件 QTL 分析结果表明，籽粒 宽度在单个 QTL 水平对千粒重贡献最高，其次是籽粒长度，粒径比在单个 QTL 水平对 千粒重贡献最低；穗长、小穗数