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AP2ERF转录因子与水稻产量关基因LRK6等位基因的表达差异
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复旦大学博士论文
复旦大学博士论文 水稻LRK6等位基凶的顺式渊控
摘 要
为了更有效的通过遗传工程的手段进行育种,至关重要的一点就是分析清楚 基因的功能及其表达调控。我们实验室先前的工作中,通过图位克隆的方法从以 东乡野生稻(Oryza rufipogon Griff.)为供体与以桂朝2号(Oryza sativa L.ssp. Indica)为受体的BC4F2群体rfl获得了一个与水稻高产有关的QTL位点qGY2.J『,
实验证明这个QTL位点促进水稻谷粒子增加从而对产量的贡献率达到16%。基 因结构分析表明这个QTL位点由三R朋.LRK8(1eucine.rich repeat receptor-like kinase,ZRh3,八个编码富含亮氨酸重复序列型类受体激酶新基因所组成的基因 簇。有趣的是,我们发现该LRK家族基因在粳稻日本晴(Oryza sativa L.subsp. Japonica IJaF.Nipponbare);gl籼稻93.1 1(Oryza sativa L.subsp.Indica vat:.93.11)的 杂交后代中存在等位基因表达差异的现象。LRK家族基因巾的一员,LRK6基因 在籼粳杂交后代中来源不同亲本的等位基因均有表达,但是对于该后代中LRK6 基因总转录水平的贡献却不一致。在亲本中,日本晴中的LRK6基因的表达量远 远高于93.1 1中。在籼粳杂交后代巾,来源于不同亲木的LRK6等位基因于其在 亲本中的表达量相似。这种现象,我们推测是由于等位基因启动子顺式元件所造 成的。通过对LRK6启动子的递减分析,我们发现有两个启动子区域对LRK6基 因的表达存在明显影响。序列比对分析显示这两个区域的序列在籼稻93.11、粳 稻日本晴和东乡野生稻中存在差异。其中一个启动子区域,我们命名为DSLP2 (Different Sequence ofLRK6 Promoter 2),可能具有潜在的转录因子结合位点。使
用酵母单杂交的方法,我们获得了一个乙烯响应因了(ERF)蛋白与该片段互作。
序列分析和GCC.box互作分析说明,这是一个乙烯响应转录因子基N(OsERF3), 属于ERF家族的第二类转录因子,除含有一个ERF域之外,还有一个具有抑制 下游基因表达功能的EAR域。我们通过碱基突变实验确定OsERF3基因与DSLP2
区域中的一个未报道的元件(5’.TAA(A)GT-3’)互作。激素处理实验和伪职乃基
因过量表达实验结果显示,OsERF3基因可能直接抑制93.1 1中的LRK6基因的 表达,但是对日本晴的LRK6基因的表达没有明显的直接抑制。所有实验的结果 综合来看,OsERF3基因,一类乙烯响应的转录因子,与水稻LRK6基因启动子 上的元件互作,很有可能导致了籼粳杂交后代中来源不同亲本的等位基因表达差 异的现象。为进一步研究水稻产量基因的调控和了解植物杂种优势的机理,做出 了一些新的尝试。
关键词:水稻,递减分析,差异表达,乙烯响应因了(ERF),抑制了,TAA(A)GT 元件。
复旦大学博士论文
复旦大学博士论文 查塑!坐篁垡墨鬯丝坚茎型笙
Abstract
To practice efficient breeding through genetic engineering techniques,it is important to identify the function and expression regulation of the gene.We previously map.cloned a gene cluster including eight leucine—rich repeat receptor-like kinase (三R的genes in Dongxiang wild rice(Oryza rufipogon Griff.),which increased grain yield by 1 6%.Interesti ngly,we detected allelic expression variation in the LRK gene cluster,in which alleles o
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