月月桂AACT基因cDNA全长克隆和生物信息学分析.PDFVIP

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2018-12-18 发布于湖北
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月月桂AACT基因cDNA全长克隆和生物信息学分析.PDF

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第35 卷第6 期中南林业科技大学学报 Vol. 35 No. 6 2015 年6 月 Journal of Central South University of Forestry Technology Jun. 2015 Doi:10.14067/j .cnki.1673-923x.2015.06.016 http : // 月月桂AACT基因的cDNA全长克隆及生物信息学分析 1,2 2 1 1 1 3 郑玉娟，周文化，张党权，陈丽莉，陈容，龚建平（1. 中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室，湖南长沙 4 1004；2. 稻谷及副产物深加工国家工程实验室，湖南长沙4 10004；3. 湖南澧县树大园林有限公司，湖南澧县 4 15513 ）摘要：为了克隆分离月月桂AACT （乙酰辅酶A 酰基转移酶）全长基因，并研究其基因特征和蛋白结构，以月月桂花瓣RNA 为模板，通过反转录PCR 及RACCE 技术分离克隆AACT 全长。再利用NCBI 网站及生物信息学软件对其碱基分布、氨基酸组成、亲疏水性、二级结构、保守区及三级结构进行预测和分析，并对 10 个物种的AACT 氨基酸进行多重比对，对基因进行进化分析。分离克隆出AACT 基因的cDNA 序列长为1580bp, 编码405 个氨基酸，该蛋白质相对分子质量为4 1347.89D ，等电点为5.66，其中Ala 含量最高为14.53%，平均疏水值为0.2 15，属Cond-enzymes 超家族。氨基酸序列比对中，胡黄连、假马齿苋氨基酸序列同源性最高。 OsAACT 基因稳定，编码的蛋白为疏水性蛋白，其在进化过程中相对保守。试验获得的基因信息为萜类物质合成途径进一步研究奠定基础。关键词：月月桂；乙酰辅酶A 酰基转移酶；全长cDNA 克隆；生物信息学分析中图分类号：S759.95；Q781 文献标志码：A 文章编号：1673-923X(2015)06-0087-06 Full length cloning and bioinformatics analysis of Acetyl-CoA C-acetyltransferase gene in Osmanthus fragrans 1,2 2 1 1 1 3 ZHENG Yu-juan , ZHOU Wen-hua , ZHANG Dang-quan , CHEN Li-li , CHEN Rong , GONG Jian-ping (1. Human Provincial Key Lab. of Forestry Biotechnology, Central South University of Forestry and Technology, Changsha 410004, Hunan, China; 2. National Engineering Lab. for Rice and Byproducts Processing, Changsha 410