微阵列数据处理平台设计和实现.PDFVIP

·610 · 南方医科大学学报（J South Med Univ ） 2011;31(4) ·技术方法· 微阵列数据处理平台设计与实现 孙显赫，郭云波，刘 娜，马 骊，邓亲恺 南方医科大学基础医学院生物信息学研究室，广东 广州 510515 摘要：目的研制一个基于高性能计算机和Linux 下运行的采用B/S 模式的微阵列数据处理平台。方法构建以Apache 服 务器为平台的WEB 服务器，采用Perl语言编程，整合R语言与Bioconductor 中的微阵列数据分析软件包，满足寡核苷酸微 阵列和双色点样微阵列实验数据的处理和分析，用户可在网页上提交数据和设置参数，结果通过网页以图形化的方式返 回。结果该平台可处理寡核苷酸微阵列和双色点样微阵列的数据，实现了数据质量评估、预处理、注释、统计分析等功 能，操作简单，分析速度快。运用本平台处理了结核杆菌不同临床分型的人类巨噬细胞寡核苷酸微阵列数据，即潜伏期、 结核病、结核性脑膜炎，为识别