梨种质资源SSR引物筛选和评价.PDFVIP

第32 卷 第7 期 中 南 林 业 科 技 大 学 学 报 Vol. 32 No. 7 2012 年7 月 Journal of Central South University of Forestry Technology Jul. 2012 梨种质资源SSR引物的筛选与评价 a,b a,b a,b a,b a,b 许靖诗 ，乌云塔娜 ，叶生晶 ，王 淋 , 冯延芝 （中南林业科技大学 a. 经济林育种与栽培国家林业局重点实验室；b. 林学院, 湖南长沙 4 10004 ） 摘 要： 目前在梨种质研究中仍然缺乏足够的SSR 引物，因此筛选多态性丰富的SSR 标记引物，为进一步研 究梨种质资源的群体遗传学特征等提供参考。运用SSR 标记技术，从初选后的42 对SSR 引物中筛选出多态性好、 稳定性高的引物。筛选出的12 对引物对40 个梨样的DNA 序列进行了SSR-PCR 扩增, 共检测出159 个等位基因， I Nei 平均每个位点检测到13.25 个等位基因; 平均每个等位基因有效数目为1.236 4, 平均 值为0.286 6，平均 指 数值为0.165 3; 系统聚类分析表明，所有样品可以分为3 个类群，即栽培梨、日本梨、野生秋子梨。筛选的12 对多态性丰富的SSR 引物适合用于梨种质资源群体遗传学特征分析，为梨种质资源的收集、保存、鉴定、评价 以及亲缘关系研究提供方法和理论依据。 关键词：梨；种质资源；SSR 分子标记；引物筛选 中图分类号： S722.3; S661.2 文献标志码：A 文章编号：1673-923X (2012)07-0080-06 SSR primer screening and assessment on pear germplasm resources XU Jing-shia,b,WUYUN Ta-naa,b, YE Sheng-jinga,b, WANG Lina,b, FENG Yan-zhia,b (a. Key Lab of Non-wood Forest Product of Forestry Ministry; b.School of Forestry , Central South University of Forestry and Technology, Changsha 410004,Hunan,China) Abstract: At present, the pear germplasm study lacks enough SSR primers, thus it is necessary to screened out SSR markers primer showing high polymorphismin and to further study the population genetic characteristics. The good polymorphism and high stability primers were selected out from the 42 pairs of SSR primers by SSR molecular primer. The 40 pear samples ’ DNA sequence were amplified with 12 pairs of SSR primers by SSR-PCR techn