蛋白质与蛋白质药物.pptVIP

(二) 蛋白质的构象(conformation) 蛋白质的分子构象又称空间结构、立体结构、高级结构或三维构象等。它包括二级结构，三级结构和四级结构。 蛋白质分子构象是指蛋白质分子中原子和基团在三维空间上的排列分布及肽键的走向。 维持蛋白质构象的化学键 蛋白质一级结构的主要化学键是肽键也有少量二硫键。而维持蛋白质空间结构的化学键主要是一些次极键。次极键虽然键能小，稳定性差，但由于数目众多，因此在维持蛋白质分子的空间构象中起极为重要的作用。 主要的次极键有：氢键，疏水键，盐键，配位键, 二硫键。 1、氢键 由连接在一个电负性大的原子上的H与另一个电负性大的原子相互作用而成，氢键是次极键中键能最弱的，但数目最多，所以是最重要的次极键，也是维持蛋白质二级结构的主要次极键。 2、疏水键 由两个非极性基团，因避开水相而群集在一起的作用力，是维持蛋白质三级，四级结构的主要次极键。 3、盐键(又叫离子键) 它是蛋白质分子中带正电荷基团和负电荷基团之间的静电吸引所形成的化学键。 4、配位键 蛋白质与金属离子结合中，常含有配位键，如细胞色素，血红蛋白等均含有铁与蛋白质形成的配位键。 5、二硫键 是由两个硫原子间所形成的化学键(较强的化学键)。 左手螺旋与右手螺旋 α螺旋主要的结构特点 α螺旋主要的结构特点 ?-螺旋 （1）螺旋走向，稳定以氢键连接，氢键与轴平行。 （2）侧基R伸向螺旋外侧。 （3）棒状结构，高度压缩，紧密排列。 （4）规律排列 （5）由1条充分伸展的肽链的肽键平面折叠成的右手螺旋。 （6）每隔3.6个氨基酸残基螺旋上升一圈，螺距0.54nm。 （7）1个螺圈内有13个原子。 三股螺旋 胶原蛋白的三股螺旋 ?-折叠 ?-折叠是由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列，通过链间的氢键交联而形成的。肽链的主链呈锯齿桩状α-碳原子总是处于折叠的角上，氨基酸的R基团处于折叠的棱角上并与棱角垂直，两个氨基酸之间的轴心距为0.35nm。 ?-折叠有两种类型。一种为平行式，即所有肽链的N-端都在同一边。另一种为反平行式，即相邻两条肽链的方向相反。 β折叠结构 转角 转角结构 转角结构 ?-转角 ?-转角也称?-回折或发夹结构，存在于球状蛋白中。 在?-转角部分，由四个氨基酸残基组成; 弯曲处的第一个氨基酸残基的 -C=O 和第四个残基的 –N-H 之间形成氢键，形成一个不很稳定的环状结构。 无规卷曲 超二级结构 （1）α×α （2）β×β （3）β迂回 （4）β折叠桶 （5）βαβ 结构域(structural domain) 结构域是蛋白质三维折叠中的一个层次，主要是相邻的二级结构片段集装在一起形成超二级结构，在此基础上，进一步折叠成近乎球状，相对独立的三维实体，这个区域称为结构域。 由此可见：结构域： 1）构成基础是超二级结构，2）相当独立区域，3）属于三级结构。 而超二级结构概念：蛋白质分子中α-螺旋，β-折叠，β-转角等集合在一起，彼此相互作用，形成有规则的在空间上能辨认的二级结构组合体，称超二级结构，有三种类型。 蛋白质的三级结构总结 蛋白质的三级结构(Tertiary Structure)是指在二级结构基础上，肽链的不同区段的侧链基团相互作用在空间进一步盘绕、折叠形成的包括主链和侧链构象在内的特征三维结构。 维系这种特定结构的力主要有氢键、疏水键、离子键和范德华力等。尤其是疏水键，在蛋白质三级结构中起着重要作用。 蛋白质的四级结构 概念 (1) 亚基 (subunit) 亚基也叫做亚单位，也有人称之为原聚体或单体。多由一条多肽链折叠而成，具有一二三级结构。 一般亚基没有活性，当它们构成具有完整结构的蛋白质时，才表现出生物活性。 (2) 蛋白质的四级结构是由两个或两个以上的亚基之间相互作用，彼此以非共价键相连而形成的更复杂的构象。四级结构实际上就是亚基的立体排布、相互作用及接触部位的布局。 维持蛋白质四级结构的主要化学键是疏水键，它是由亚基间氨基酸残基的疏水基相互作用而形成的。 亚基之间不含共价键，亚基间次级键的结合比二、三级结构疏松，因此在一定的条件下，四级结构的蛋白质可分离为其组成的亚基，而亚基本身构象仍可不变。 一种蛋白质中，亚基结构可以相同，也可以不同。相同的称为同型亚基，不同的则称为异型亚基。如烟草斑纹病毒的外壳蛋白是由2200个相同的亚基形成的多聚体；正常人血红蛋白A是两个α亚基与两个β亚基形成的四聚体；天冬氨酸氨甲酰基转移酶由六个调节亚基与六个催化亚基组成。 由2