生物化学课写件蛋白质结构与功能.pptVIP

五、蛋白质的结构 蛋白质是由一条或多条多肽链以特殊方式组合成的生物大分子。 蛋白质与多肽并无严格的界线，通常是将分子量在6000道尔顿(dalton,d)以上的多肽称为蛋白质。 蛋白质分子量变化范围很大, 从大约6000到100万道尔顿甚至更大。 1.构型和构象 构型(configuration)：立体异构体分子中取代原子或者基团的取向。这种排列的改变会牵涉到共价键的形成和破坏，但与氢键无关。例如氨基酸的D-和L-型。 构象(conformation)：取代基团单键旋转时形成的不同的立体结构，这种空间位置的改变会牵涉到氢键的形成和破坏，但共价键不被破坏。 2.蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构(primary structure)指蛋白 质分子中氨基酸残基的排列顺序。 蛋白质的化学结构包括组成蛋白质的多肽链 数目，多肽链的氨基酸序列，以及多肽链内 或链间二硫键的数目和位置。 二硫键（disulfide bond）：由肽链中相应部 位上两个半胱氨酸残基的侧链脱氢形成。 蛋白质一级结构测定的步骤 （1）蛋白质样品的预处理； （2）测定每条多肽链的氨基酸组成； （3）测定多肽链的N-末端和C-末端； （4）应用两种或两种以上不同的水解方法将所要测定的蛋白质断裂，各自得到一系列大小不同的肽段； （5）分离提纯所产生的肽，并测定它们的序列； （6）从有重叠结构的各个肽的序列中推断出蛋白质中全部氨基酸顺序。 （3）分析多肽链的N-末端和C-末端; 肼解法 多肽与肼在无水条件下加热，C-端氨基酸即从肽链上解离出来，其余的氨基酸则变成肼化物；肼化物能够与苯甲醛缩合成不溶于水的物质而与C-端氨基酸分离。 3、多肽链折叠的空间限制 肽键带有双键的性质，主链上1/3的键不能自由旋转。肽键中的四个原子和它相临的两个α—C原子都处于一个平面上（酰胺平面）。 多肽链＝通过可 旋转的α- 碳 原 子连接的酰胺平面链  二个肽平面旋转时受到α—C原子上侧链R基空间位阻的影响。 蛋白质的二级结构 蛋白质的二级结构(Secondary Structure) 是指蛋白质多肽链本身的折叠和盘绕方式。 它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。 主要有?-螺旋、?-折叠、?-转角、无规卷曲等。 （1）?-螺旋(?-helix)——最常见 多肽链中的各个肽平面围绕同一轴旋转，形成螺旋结构，螺旋一周，沿轴上升的距离即螺距为0.54nm,含3.6个Aa残基；两个Aa之间的距离为0.15nm； Aa残基侧链伸向外侧，相邻的螺圈之间形成链内氢键； 天然蛋白质的?-螺旋通常都是右手?-螺旋。 氢键的取向几乎与轴平行，第一个氨基酸残基的酰胺基团的-CO基与第五个氨基酸残基酰胺基团的-NH基形成氢键。 ?-螺旋有左旋和右旋两种，右旋比左旋更加稳定，因此也更常见。 影响?-helix不稳定的因素： a. 多肽链中连续存在带相同电荷的氨基酸； b.多肽链中有Pro时，则α－helix中断，产生一个“结节”； （2）β－折叠(β－pleated sheet) 两条或多条几乎完全伸展的肽链通过链间的氢键交联而形成的； 肽链的主链呈锯齿状折叠构象，R基团处于折叠平面的两侧。 β－折叠中的 氢键与α-螺 旋中的氢键有 何不同？ （3）β－转角（β－turn）或β－迴  转结构（β－reverse turn） 多肽链经常出现180°的回折，这个回折角就是 β－转角结构； 它由四个Aa残基组成; 回折处的第一个Aa残 基的 -C=O 和第四个 Aa残基的 –N-H 之间 形成氢键，形成一个不很稳定的环状结。 （4）无规卷曲（nonregular coil）  或自由回转（random coil) 没有一定规律的松散的肽链结构，通常酶的活性中心常处在这一构象区域里。 4.超二级结构和结构域 超二级结构(supersecondary structure)： 是指若干相邻的二级结构中的构象单元彼 此相互作用，形成有规则的，在空间上能 辨认的二级结构组合体。通常有βαβ， βββ，αα，ββ 。 结构域（domain） ：是在超二级结构 基础上进一步卷曲折叠成紧密的近似 球状的结构，在空间上彼此分隔，各 自具有部分生物功能的结构。 5.三级结构（Tertiary Structure） 在二级结构基础上，肽链不同区段的侧链基团相互作用，进一步盘绕、折叠形成的的空间结构。 维系这种特定结构的力主要有氢键、疏水键、离子键、范德华力和二硫键、配位键等。 6.四级结构（Quaternary Structure） 由两条或两条以上具有三级结构的肽链聚合而成的特