花叶矢竹转录组调控序列中转座子分布.docxVIP

浙江农林大学本科生毕业设计（论文） PAGE \* MERGEFORMAT 3 PAGE \* MERGEFORMAT 3 本 科 生 毕 业 设 计（论文） （ 2011 届） 林业与生物技术学院 题 目：花叶矢竹转录组调控序列中 转座子的分布 学生姓名： 郦 元 学　　号： 201101220430 专业班级： 生物科学111 指导教师： 周 明 兵 2015年 4 月17日 本科生毕业设计（论文）诚信承诺书 我谨在此承诺：本人所写的毕业设计（论文）《花叶矢竹转录组调控序列中转座子的分布》均系本人独立完成，没有抄袭行为，凡涉及其他作者的观点和材料，均作了引用注释，如出现抄袭及侵犯他人知识产权的情况，后果由本人承担。 承诺人（签名）： 郦元 2015 年 4 月 17日  目 录 摘要4 ABSTRACT4 1 文献综述5  1.1 转座子概述5  1.2 转座子在基因组中的分布5  1.3 转座子转座对宿主的影响6  1.4 转座子的分类6 2 材料与方法8  2.1 实验材料8  2.2 实验方法9 3 结果与分析11  3.1 实验讨论25 参考文献25  花叶矢竹转录组调控序列中转座子的分布 浙江农林大学 生物科学111 郦元 指导老师：周明兵 摘要：转座子（transposon)是一大类广泛存在于高等植物基因组中的可以通过不同转座机制进行转移的DNA序列。转座子通过转录或者逆转录将其自身的拷贝插入到基因组的目标位点。二十世纪四十年代Barbara McClintock首次发现转座子后，随着越来越多的物种基因组被测序，基因组序列被公布，发现转座子在各类生物体的基因组中广泛分布，同时随着研究的深入，发现转座子对其宿主有着重要的作用，如引起宿主基因组序列的扩增、删除、断裂、倒位、移位等重排作用。花叶矢竹是矢竹的一个栽培变种，是一种主要用于园林绿化的优良珍稀观赏竹种。花叶矢竹基因组中含有多类转座子，下载花叶矢竹基因组中的转录组序列，利用花叶矢竹转录组序列和RepeatMasker软件计算出各种类型的转座子在转录组序列中的分布情况。在对花叶矢竹转录组序列中转座子分布的数据研究中，结果发现每类转座子在转录本的不同生长发育阶段的含量各不相同。深入的研究转座子在花叶矢竹基因组中的分布有助于我们进一步了解转座子对花叶矢竹绿叶变异起到的作用。 Abstract： Transposon is a kind of DNA sequence widely existing in the higher plant genome, which is transferable by the virtue of different transposition mechanism. Transposon copy itself inserter into the target site of genome by means of transcription or reverse transcription. After Barbara McClintock first discovered in the 1940s, with more and more species genome being sequenced and published, transposon is found widely spreading in all kinds of organisms genome and it plays an important role in the host genome, such as amplification, delete, fracture, inversionand shift. Pseudosasa japonica cv Akebono-suji is a cultivar of Pseudosasa japonica, it is a kind of is mainly used for landscaping of rare ornamental bamboo species. There are many transposons in the Pseudosasa jap