南海北部陆坡深水区沉积物细菌多样性调查.PDF

南海北部陆坡深水区沉积物细菌多样性调查 王 　鹏 ,李 　涛 ( 同济大学 海洋地质国家重点实验室 ,上海 200092) 摘要 : 采用分子生物学手段 ,调查南海北部陆坡深水区沉积物细菌多样性 。分析表明其细菌分成 5 个类群 , ( ) ( ) ( ) ( 变形细菌门 Prot eobact eria ,厚壁菌门 Firmicut es ,浮霉菌门 Planctomycet es ,拟杆菌门 Cytop haga/ Flexi ) ( ) bact eria/ Bact eroides ,简称 CFB 及脱铁杆菌门 Deferribact eres 。分别 占总体的 34 % ,38 % , 18 % ,4 % ,6 % 。 其中60 %以上的克隆子与硫代谢相关 ,20 %克隆子最相近序列来自于油污染环境 ,说明硫代谢是该区域物质 代谢的重要组成 , 同时该区域有油气渗透的烃类物质存在并影响着该区域的微生物群落结构 。 关键词 :南海北部陆坡 ;细菌多样性 ;微生物勘探 中图分类号 :Q938 . 1 　　　　　文献标识码 :A 　　　　　文章编号 (2008) 　　微生物作用与油气资源的生成 、聚集 、储存 、勘 1 . 2 　总 DN A 的提取与纯化 探等各个环节都有密切联系 。微生物作用使沉积物 沉积物样品中总 DN A 提取采用 SD SC TAB 抽 中有机质向利于生烃的物质转化 , 同时对有机物的 提法[4 ] 。粗提的 DN A 用 U N IQ10 柱式 DN A 胶回 保存与富集有积极作用[ 1 ] ,研究微生物与油气资源 ( ) 收试剂盒 上海生工 纯化 ,按照说明书操作 。 的关系 ,并根据微生物的特点开发油气资源已成为 1 . 3 　16 S rDN A PCR 扩增 必然趋势 ,但 目前微生物石油研究多集中于陆地和 ( 浅水区域 。自20 世纪 70 年代末期以来 , 随着美国 利用细菌 16 S rDN A 的特异 引物 27 F : A GA 墨西哥湾 、巴西坎皮斯盆地和西非等深水油气勘探 GT T T GA TCM T GG C TC A G ; 1492 R : GGT TA C 不断获得成功 ,深水勘探在全球蓬勃发展起来 ,深水 C T T GT T A C G A C T T ;M 为 A 或 C) [ 5 ] , 以纯化后 微生物勘探与开发也开始起步[2 ] 。 的总 DN A 为模板进行 PCR 扩增 。PCR 反应在 Bi μ 南海是西太平洋最大的一个边缘海 ,其北部陆