微生物学通报禾本科植物内生真菌研究20基于NRPS微生物学报.PDF

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微生物学通报禾本科植物内生真菌研究20基于NRPS微生物学报

微生物学通报 Oct. 20, 2018, 45(10): 2200−2208 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.180266 简 报 禾本科植物内生真菌研究 20 :基于NRPS5 基因的我国东部早 熟禾亚科植物内生真菌系统发育学分析 * 郭萍 王冠华 纪燕玲 于汉寿 王志伟 ( 210095) 摘 要:【背景】冷季型禾草-Epichloae 真菌内生共生体在我国广泛存在,Epichloae 内生真菌具 有遗传多样性。【目的】选取来自江苏、山东和安徽等6 省共8 地的早熟禾亚科植物中的21 个 Epichloë sp. 菌株,检测菌株的NRPS5 基因;分析不同宿主内Epichloë 属内生真菌NRPS5 基因 多样性。【方法】提取Epichloë spp. 菌株DNA ,利用特异性引物对菌株中NRPS5 基因进行PCR 检测和序列分析,并基于NRPS5 基因构建最大简约法系统发育树。【结果】NRPS5 基因可能广 泛分布于我国东部冷季型禾本科植物Epichloae 内生真菌中。在同种内生真菌和同一宿主(除鹅 观草) 中的不同种内生真菌中NRPS5 基因相对保守,但不同宿主的内生真菌其碱基序列差异大, 与宿主植物采集地点、采集时间和子座的有无均无相关性,NRPS5 基因的差异主要与宿主植物 有关。这说明NRPS5 基因序列比较保守,推测属于NRPS 蛋白的功能核心区。【结论】NRPS5 基因序列相对保守,可作为真菌遗传多样性分析的一种辅助手段。 关键词:NRPS5 基因,Epichloae ,早熟禾亚科植物,遗传多样性 Grass endophyte researches 20: Genetic phylogeny analysis of endophytes inhabited in gramineous plants in east China based on NRPS5 GUO Ping WANG Guan-Hua JI Yan-Ling YU Han-Shou WANG Zhi-Wei (Key Laboratory of Agricultural Environmental Microbiology, Ministry of Agriculture, College of Life Sciences, Nanjing Agricultural University, Nanjing, Jiangsu 210095, China) Abstract: [Background] Epichloae endophyte-cool season grasses associations spread widely in China, there is genetic diversity in endophyte. [Objective] We collected plants from 8 cities of 6 provinces throughout China and hundreds of strains were obtained. NRPS5 genes of 21 Epichloë spp. strains obtained from endophyte-grass associations were detected. Genetic diversity of NRPS5 genes in Epichloë spp.

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