第4章 核酸资料.ppt

2 戊糖 DNA中戊糖的为β-D-2-脱氧核糖 (deoxyribose) RNA中的戊糖的为β-D-核糖 (ribose) 3.核苷（nucleoside） 核苷酸是由核苷和磷酸脱水缩合而成的，是核苷的磷酸酯。 核苷的5’-OH磷酸化，自然界的核苷酸多为核苷-5’-磷酸。 核苷单磷酸（NMP）是指核苷的单磷酸酯。核苷单磷酸可以通过一次成酐反应形成核苷二磷酸（NDP）。核苷二磷酸再通过一次成酐反应生成核苷三磷酸（NTP）。 碱基紫外吸收特性 4.3 DNA的结构 4.3.1 一级结构 Primary Structure CAAGTGACGCGCCCACCGAGCAGAAAGAACACCCCCATGACAGCACCCTGGAACGACCCCCCGCCCGTCGCCGAACGCGTCGACGCCCTGTGCAGGAGCTGAGCCTCGAGGAGAAGGCCGGTAGCTGGCAGCTACTGGCTGCGCCCGACCCGGAGGAGGCCACGGGCGGCGCGGCCCCCATGGAGTCCGCCTTGCCGACGACCGCTCGACCTTCGAGGCCGCGATGCGCACGGTCTCGGCCACATCACCCGGGCCTTCGGCAGCGCCCGATCTCGGCCGCGACGGGGTGGAGCACCTGCGCACCCTGCAGCGCCAGGTCGTGGAGACCTCCCGGCTCGGGATCCCGGCC 4.3.2 二级结构 Secondary Structure 一、 DNA双螺旋结构模型要点 （1）DNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称DNA单链)组成。两条链沿着同一根轴平行盘绕，形成右手双螺旋结构。螺旋中的两条链方向相反，即其中一条链的方向为5’端→3’端，而另一条链的方向为3’端→5’端。 （3）螺旋横截面的直径约为2nm，每条链相邻两个碱基平面之间的距离为0.34 nm，DNA的每轮螺旋的轴距为3.6nm，因此双螺旋DNA的每轮螺旋包含10.5个碱基对。 （4）维持两条DNA链相互结合的力是链间碱基对形成的氢键。碱基结合具有严格的配对规律:A与T结合，G与C结合，这种配对关系，称为碱基互补。A和T之间形成两个氢键，G与C之间形成三个氢键。 在DNA分子中，嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。 ①碱基堆积力(疏水作用力和范德华力），形成疏水环境 ②碱基配对的氢键，GC含量越多，越稳定 ③磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子或组蛋白的正离子之间形成离子键，中和了磷酸基上的负电荷间的斥力，有助于DNA稳定。 三、DNA二级结构的多型性 1. B-DNA 相对湿度92%时制备的DNA钠盐纤维的构象； 典型的Watson-Crick双螺旋DNA 右手双股螺旋 2. A-DNA 相对湿度为75%时制备的DNA钠盐纤维的构象 右手双螺旋，外形粗短 RNA-RNA、RNA-DNA杂交分子具有这种结构 相对缺水的溶剂或某些生理状态下可能观察到A-DNA。 3. Z-DNA 左手双螺旋DNA DNA骨架呈锯齿状 天然B-DNA的局部区域可以形成Z-DNA 嘧啶碱基与嘌呤碱基交替出现，特别是C和G，易形成Z-DNA 三种DNA双螺旋构象比较 四、 DNA三股螺旋和四股螺旋 DNA三股螺旋 DNA三股螺旋 五、DNA结构的多样性 4.3.3 DNA的高级结构 螺旋和超螺旋电话线 超螺旋的特点 ①拓扑异构酶I（拧紧） 能使双链负超螺旋DNA转变成松驰形环状DNA，每一次作用可使L值增加1 ②拓扑异构酶II（拧松） 能使正超螺旋转变成松驰DNA 每次催化使L减少2 4.3.4 DNA在真核生物细胞核内的组装 生物体内的核酸通常都与蛋白质结合形成复合物，以核蛋白的形式存在。 原核生物基因组主要通过与碱性蛋白结合并形成突环而组装成拟核。 真核生物的染色体更复杂，具有不同的组装结构。 核小体 串联 纤丝 螺旋圈 染色体 4.3.5 DNA结构与功能的关系 （一）DNA是遗传物质 （二）基因是DNA分子上的一段序列 基因是DNA上的一段编码某种多肽链或RNA的序列。 （三）DNA双螺旋结构提供了遗传信息传递的基础 （四）基因指导蛋白质合成 4.4 DNA序列分析 测定DNA核苷酸序列的基本原则： ①首先要获得高纯度的、均一完整的DNA或DNA的某个（或某几个）基因片段； ②用DNA限制性内切酶降解，以获得一套大小不同的片段，并确定这些片段在原来大分子中的前后顺序； ③测定每个片段的核苷酸序列。 4.4.1 DNA限制性内切酶 （一）DNA的限制与修饰 限制性核酸内切酶(restriction endonuclease, RE)是识别DNA的特异序列,