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第三章四核酸化学

第一节 核酸概述 第二节 核酸的分子组成 第三节 核酸的分子结构 第四节 核酸的理化性质 第五节 核酸酶(nucleases) 细胞内的其他核苷酸及核苷酸衍生物 多磷酸核苷酸 ADP、ATP、GDP、GTP等。 ATP的重要生理功能: ① 参与能量代谢。 ② 各种三磷酸核苷酸参与DNA 、RAN的生物合成(作原料); ③ 参与其它合成。如UTP参加糖转化、合成,CTP参与嘌呤、蛋白质的合成; ④ 作辅酶的结构成分。如NAD+、 NADP+。 DNA双螺旋结构的特点 DNA的双螺旋结构是分子中两条DNA单链之间基团相互识别和作用的结果。 双螺旋结构是DNA二级结构的最基本形式。 DNA双螺旋结构的要点 (1)DNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称DNA单链)组成;右手双螺旋结构;两条链方向相反,5′端→3′端;3′端→5′端。 (2)嘌呤和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧。 (3)螺旋横截面的直径约2nm,每条链相邻两个碱基平面之间的距离为0.34 nm,每10个核苷酸形成一个螺旋,其螺矩为3.4 nm。 (4)维持两条DNA链相互结合的力是链间碱基对形成的氢键。碱基结合具有严格的配对规律:A与T结合,G与C结合,这种配对关系,称为碱基互补。 A=T,G≡C A+G=T+C DNA双螺旋的稳定性 DNA双螺旋结构在生理条件下很稳定。 维持这种稳定性的因素包括:两条DNA链之间形成的氢键,碱基堆积力。 双螺旋结构内部形成的疏水区,消除了介质中水分子对碱基之间氢键的影响; 介质中的阳离子(如Na+、K+和Mg2+)中和了磷酸基团的负电荷,降低了DNA链之间的排斥力等。 改变介质条件和环境温度,将影响双螺旋的稳定性。 1 、双螺旋DNA分子在二级结构基础上进一步扭曲 折叠形成的特定构象。 2 、环形双链DNA分子可以进一步扭曲成超螺旋结 构,首尾可共价连接成环状,分为负超螺旋、正超 螺旋。 1、蛋白质 染色体蛋白主要分为 组蛋白和非组蛋白两类。 真核细胞的染色体中,DNA与组蛋白的质量比约为1:1。DNA、组蛋白和非组蛋白及部分RNA(尚未完成转录而仍与模板DNA相连接的那些RNA,其含量不到DNA的10%)组成了染色体。 组蛋白是染色体的结构蛋白,分为H1、H2A、H2B、H3及H4五种,与DNA共同组成核小体。 Mononucleosomes typically have ~200 bp DNA. End-trimming reduces the length of DNA first to ~165 bp, and then generates core particles with 146 bp. The 10 nm fiber is a continuous strong of nucleosomes. 三、RNA的结构特点 RNA是单链分子,因此在RNA分子中,嘌呤的总数不一定等于嘧啶的总数。 RNA分子中,部分区域也能形成双螺旋结构,不能形成双螺旋的部分,则形成单链突环。这种结构称为“发夹型”结构。 在RNA的双螺旋结构中,碱基的配对情况不象DNA中严格。G 除了可以和C 配对外,也可以和U 配对。G-U 配对形成的氢键较弱。不同类型的RNA, 其二级结构有明显的差异。 tRNA中除了常见的碱基外,还存在一些稀有碱基,这类碱基大部分位于突环部分。 (二)tRNA的结构与功能 * tRNA的一级结构特点 含 10~20% 稀有碱基,如 DHU、 ?、I 3′末端为 - CCA-OH 5′末端大多数为鸟嘧啶G或C 具有 T?C 环 二、核酸的紫外吸收性质P249 最大吸收峰在260nm 三、核酸的变性与复性 P250 (一)核酸的变性 1、核酸的变性的概念 指核酸的双螺旋区的氢键断裂,变成单链,并不涉及共价键的断裂,分子量不变,一级结构不发生变化。 2、变性因素:加热、酸碱度改变、有机溶剂、酰胺、尿素等。 3、变性表现:双螺旋解体,形成无规则线团,粘度下降,浮力密度升高;部分或全部失去生物活性;OD260增高。 DNA分子的变性 反密码环:反密码环中部的三个碱基可以与mRNA的三联体密码形成碱基互补配对,解读遗传密码,称为反密码子(anticodon)。 * tRNA的功能:活化、搬运氨基酸到核糖体,参与蛋白质的翻译。 二氢尿嘧啶环(DHU):识别氨酰-tRNA合成酶 TΨC环:识别核蛋白体(核糖体) 氨基酸臂:3`末端的CCA-OH用于连接氨基酸。 三级结构: “倒L”型 维持tRNA的作用力 : (1)氢键和碱基的上下堆积,以及疏水性等使

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