ImageJ的数字图像处理研讨.doc

ImageJ的数字图像处理研讨论文 摘要ImageJ是一个代码开放的java图像处理程序， 充分利用了 java语言的特性，为数字图像领域的研究注入 了新的活力。本文介绍了 ImageJ强大的插件功能和自身的 macro语言，并展示了在ImageJ下常用数字图像处理方法 的操作。 关键词ImageJ； macro；插件 作者简介：陈家树，男，重庆永川市人，西南大学计 算 机信息与科学学院XX级硕士研究生，研究方向：图形 图像处理。1引言 现在，关于图像处理和分析的软件或者函数库，很多 采用的都是c和c语言，对很多常见的图像处理函数都有现 成的代码和成熟的工具。然而，针对java这一面向对象程 序设计语言，却没有能很好地利用起来，在这上面开展的 工作也较少，相关的工具也很少。Imag ej的出现在一定程 度上改变了这一局面。I magej是目前世界上最快的纯java 图像处理程序。它能在秒内对一张2048x2 048的图片进行 过滤。 ImageJ不同的版本可以在Win dows, MacOS , MacOSX和 Li nux系统上运行。它能读入许多种图片格式，包括 TIFF, GI F, JPEG, BMP , DICOM 和 FIT So 它支持“栈”，也就 是一系列的图片共用一个窗口。它还是多线程的，所以像 在处理读入图片这种费时的操作时，还可以并行进行其他 的操作。它提供一些标准的图像处理函数，比如锐化、平 滑、边缘检测和中值滤波等，能对图片进行缩放、旋转和 反转等。更重要的是，ImageJ采用了一种开放式的结构， 通过加入java语言的插件来完成它的扩展。这样，使用 Image J的内置编辑器和ja va编译器就能得到各种插件。 这样的机制就使开发人员自己编写的插件能解决他所需要 解决的任何图像处理和分析的问题。与之配合使用的macro 语言，也为ImageJ带来了更多的方便。 21m agej 的 macro 语言 一个macr o就是能自动产生一系列ImageJ命令的程序。 有两种方法可以创建macro程序。最简单的一种就是使用 ImageJ 的 Plu gins/Macro s/Record 命令，这样当你使用 Ima gej菜单中的命令时，就会自动在一个Re corder中记 录下来，生成macro语句，得到macro程序。还有一种创 建方法，打开Plugins /New,在弹岀的对话框中输入创建 的ma cro程序的名字，选定“type”为“m aero”,接下来 就可以在弹出的编辑框中编写自己的macro程序了，它以 后缀名txt保存。ma cro程序提供了把多个ImageJ命 令组合起来用的途径，研究人员也可以根据自己的需要定 制。Image J可以把macro程序添加到“工具栏”上，也可 以添加进“pl ugins”菜单中，所以它的使用让开发研究变 得更加简便。 语言的变量 macro语言是一种“无类型”定义的语言。也就是变量 的使用不需要先进行声明，也不用显式给出变量的数据类 型。当它们被使用在赋值语句中时，会被自动初始化为相 对应的类型。所以一个变量就可以用来存放各种数据类型, 包括数字、字符串或者数组等。甚至在同一个mac ro程序 中，同一个变量能存放任何的数据类型。看下面这段程 序： v=;print (v);v二ast ring，z:prin t (v) : v=new Array (10, 2 0, 50) ;for (rint (v[i]);可以看到变量v” 的 使用是非常灵活的。需要注意的是，变量名是区分大小写 的，“Name”和“name ”就分别表示不同的变量。 语言的操作符 macro语言几乎支持java中所有的操作符，所以这里 就不再赘述了，有兴趣的读者可以去参看Bruce Eckel的 《Thi nking in java》第三版。 语言的i f/else, whi le循环语句 在m aero语言中，条件语句和循环语句的用法与在 java中的用法也是一样的，有兴趣的读者可以去参看Bru ceEckel 的《T hinkinginj ava》第三版。 3ImageJ良好的易扩展性 插件的应用 ImageJ的插件就是用java语言编写的，被编译为 “.class”的java类文件。它的安装非常简单：把需要用 的插件，也就是java的类文件放到Imag ej的“plugin s” 目录下，然后重新启动ImageJ,这时你就会在“Plug ins” 的下拉菜单中发现这个插件已经安装了。这里需要注意的 是，java类文件的文件名如果使用了下划线 ,在“Plugins”中会被空格替代。 根据实现功能的不同，插件被大致分为以下几类：图 像的I /0处理，图像的基本特征分析，各种滤波器，