酶学基础知识.ppt

核酸类酶的分类 （1）根据酶作用的底物是其本身RNA分子还是其他分子，将核酸类酶分为分子内催化R酶和分子间催化R酶两大类。 （2）在每个大类中根据酶的催化类型不同，将 R酶分为若干亚类。 1、分子内催化R酶 分子内催化酶是催化本身RNA分子进行反应的一类核酸类酶。 （1）自我剪切酶：在一定条件下催化本身RNA分子进行剪切反应的R酶。它们都是RNA前体，可以在一定条件下进行自我催化，使RNA前体生成成熟的RNA分子和另一个RNA片断。 （2）自我剪接酶：在一定条件下催化本身RNA同时进行剪切反应和连接反应的R酶。它们也都是RNA前体。 2、分子间催化R酶 分子间催化酶是催化其它分子进行反应的核酸类酶。 （1）RNA剪切酶：催化其他RNA分子进行剪切反应的核酸类酶。 （2）DNA剪切酶：催化DNA分子进行剪切反应的核酸类酶。 （3）多肽剪切酶：催化多肽剪切作用的核酸类酶。 （4）多糖剪接酶：催化多糖剪切和连接反应的核酸类酶。 （5）多功能R酶：催化其他分子进行多种反应的核酸类酶。 第二节??? 酶（蛋白类酶）的结构与功能 一.蛋白类酶的基本组成单位－氨基酸 蛋白类酶（P-酶）主要由蛋白质组成。蛋白质是由各种氨基酸通过肽键连接而成的高分子化合物。 氨基酸：分子中含有氨基（-NH2）和羧基（-COOH）的有机化合物。组成蛋白质的氨基酸主要有20种。 2.辅助因子 酶反应的专一性取决于酶蛋白本身，而辅助因子则直接对电子、原子或某些化学基团起传递作用，决定反应的性质。酶的辅助因子可以是无机辅助因子——金属离子（激活剂），也可以是小分子有机化合物（辅酶）。 （1）无机辅助因子 无机辅助因子主要是指各种金属离子，尤其是各种二价金属离子。 1.镁离子（Mg2+） 2.锌离子（Zn2+） 3.铁离子（Fe2+） 4.铜离子（Cu2+） 5.锰离子（Mn2+） 6.钙离子（Ca2+） （2）有机辅助因子 有机辅助因子是指双成分酶中相对分子质量较小的有机化合物。它们在酶催化过程中起着传递电子、原子或基团的作用。包括： 烟酰胺核苷酸、黄素核苷酸、铁卟啉、硫辛酸、核苷三磷酸、鸟苷、辅酶Q、谷光甘肽、辅酶A、生物素、硫胺素焦磷酸、磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺。 生物体内B族维生素几乎都是作为酶的辅助因子，参与细胞的代谢过程 二、酶的空间结构 蛋白质功能决定于其结构，不仅与其氨基酸组成（一级结构）有关，而且还与其空间结构有关（二级结构、三级结构、四级结构）。 酶蛋白空间结构的基本结构单位：螺旋结构、折叠结构、转角结构和卷曲结构等。 具有酶活性的蛋白质都是球蛋白，球蛋白分子结构有以下特征： 1、空间结构特征： (1) 在球蛋白分子中一条肽链往往是通过一部分α-螺旋、一部分β-折叠、一部分β-转角和一部分无规卷曲形成紧密的球状构象。 (2)在球蛋白分子中，大多数非极性侧链总是埋藏在分子内部形成疏水内核，而大多数极性侧链总是暴露在小分子的表面上，形成一些亲水区。 (3)球蛋白的分子表面，往往有一个内陷的空穴，往往是疏水区，对酶分子而言，此空穴正好容纳一个或两个小分子底物或大分子底物的一部分，即酶活性部位。 (4)有些球蛋白具有四级结构，这类球蛋白的分子中含两条或多条多肽链，这些多肽链彼此以非共价键相连，每一条肽链都有自己的二、三级结构。 2.维持酶蛋白分子构象的力 蛋白质的空间结构是通过各种副价键联结而成 主要有：氢键、盐键、二硫键、疏水作用、金属键和范德华力等。 3.酶的活性中心 在酶分子上，并不是所有氨基酸残基，而只是少数氨基酸残基与酶的催化活性有关。这些氨基酸残基虽然在一级结构上可能相距很远，但在空间结构上彼此靠近，集中在一起形成具有一定空间结构的区域，该区域与底物相结合并催化底物转化为产物，这一区域称为酶的活性中心(active center)或活性部位(active site)。 酶的活性中心一旦被破坏，酶将失去其催化活性。 单纯酶中，活性中心常由一些极性氨基酸残基的侧链基团所组成，如His的咪唑基、 Ser的羟基、Cys的巯基、Lys的ε-氨基、 Asp和Glu的羰基等； 而对结合酶，除上述基团以外，辅酶或辅基上的一部分结构往往也是活性中心的组成部分。 S-S 活性中心外 必需基团 结合基团 催化基团 活性中心必需基团 底物 肽链 活性中心 酶活性中心示意图 氨基酸残基的分类 1960年，考施兰德（Koshland）将酶分子中的氨基酸残基分为以下四类： 接触残基 辅助残基 结构残基 非贡献残基 接触残基 这类残基直接与底物接触，参与底物的化学转变。 如图中的R1、R2、R6、R8、R9、R163、R164、R165。 这类残基的侧链中与底物结合的基团称为结合基团，起催化作用的基团称为催化基团。有时结