基因转录调节动力学中的随机性质：涨落诱导基因开关-理论物理专业论文.docxVIP

硕士学皇论文＼fAS 硕士学皇论文 ＼fAS rFR。j丁HES：S 摘要 在Smolen等人于1998年提出的确定论模型的基础上，根据实验的结果， 本文在蛋白质的降解率和蛋白质的基本合成率上分别考虑它们的涨落。这样 原来研究的确定论非线性模型就转变成了含噪声的朗之万方程(LE)。由于实 验是无法测出基因的状态是处于开还是关。因此要研究基因的状态往往都是 考虑这段基因转录出来的蛋白质分子的浓度：蛋白质水平高则基因处于开的 状态：蛋白质水平低，则基因处于关的状态。 我们首先考虑这两个噪声的来源没有叠加即是独立来研究噪声对基因状 态的影响。可以看到源于蛋白质基本合成率的噪声强度不能引起基因状态的 转变(即基因的开关)而源于降解率噪声强度则能够实现这种开关。当进 一步研究在降解率波动作用下基因从一个态跃迁到另一个态的平均首通时 [自1(MFPT)时可以看到此时随着这个波动强度的增加，MFPT是单调递减的。 其次，由于噪声的来源往往是相互关联的，这就决定了系统的噪声是 相互关联的，所以接下来，本文对原有LE引入噪声之间的关联。在关联的 作用下，不但降解率上的波动可以控制基因状态的开关，合成率上的波动 也可以作为一个控制参数。此时的MFPT随着这些波动的强度的变化也不再 是单调的，而是出现了一个极大值。由于这个极大值的出现，使得随着波 动性的增强会出现一个“双开关”现象：基因的状态由“开”到“关”，然后又回 到“开”。这种双开关现象是仅仅由于噪声之间存在关联而引起的。同时从结 果可以看到关联强度也可以实现基因状态的转换。随着关联强度的增大，蛋 白质的水平则会由初始的主要集中在高浓度态逐渐转换到集中在低浓度态。 同时，当我们研究MFPT时发现，从高浓度态跃迁到低浓度态的MFPT随着 ll 啜声之闻的关联的增趣是单调递增购。也藏是说嗓声憋关联越强，基酲熬状 啜声之闻的关联的增趣是单调递增购。也藏是说嗓声憋关联越强，基酲熬状 态就越难发生变纯，鬻些类馘予噪声掷制磉声鹪效暴。这样对予定銮死率分 舔的研究结采与MFPT的结采袭明上罄起来{默乎楚謇相矛鹰的?菸实这鼹个 结果并不矛盾，因为我们可以葫到MFpT似乎与中阃的瞬态的几率分布的关 系嚣必密切。申阚瓣态虢粪议一个‘键道”，当瓣态瀚几率分椎高辩，逶道就 宽，泌FpT裁祗；爱之，爨磷态麴几率分布低辩，邋遵就零，MFPT就离。 从瞬态的角度熬释时候，逮两个缩果就可以很好的统一起来。如暴蹦这瓣“通 道”瑾论去解释零文褥剃豹箕德几率分耀函数与MFPT时髅，瞧楚邋溺鹩。 嗓声诱导翰基因开关酌转换建噪声对原有调节系统作用的一个较巍艇和 鍪簧的彳乍用。这蓥蒸因开关的控制参数，邵波动静强度袋蹩健稻之闷的关 联，可以作为基因药理学研究的靶参量。通过对这些参数的控制米达到特定 鹃治疗鼙静。 关键词：基因开关，转淤调节潮终，噪声，平均酋遵时间，怒态凡率分 露 硕士学泣论文MAS[FR’S 硕士学泣论文 MAS[FR’S THESIS Abstract Based on the kinetic model of genetic regulation system proposed by Smolen et哉fAm，J．Physiol+274，c531(1998臻the effects of fluctuations in the degra- dation reaction rate and the synthesis reaction rate of transcription factor have been investigated through the numerical computation and the analysis theory． Since the state of gene should not be observed obviously,it is often to study the state of gene through the level of the protein expressed by the gene in cells． If the level of the protein is high，the gene is thought to be open。If tile level is low，the gene is thought to be close。 In the case of uncorrelated noises，it is shown that only the fluctuation of degradation reaction rate can induce a switch process，and the mean first passage