基因表达数据的分析与处理-控制理论与控制工程专业论文.docxVIP

摘 摘 要 论 文 题 目: 基 因表 达 数 据 的 分 析 与 处 理 学 科 专 业 : 控 制 理 论 与 控 制 工 程 研 究 生 : 吴 敏 签 名 : 吴冬 指 导 教 师 : 刘 丁 教 授 签 名 : 从 }们 季 瑞 瑞 讲 师 签 名 : 摘 要 生 物 信 息 学 是 连 接 生 物 数 据 与 医 学 研 究 的桥 梁 ，是 随着 人 类 基 因 组 计 划 的 启 动 而 兴 起 的 一 门新 的 交 叉 学 科 。基 因 组 学 、 蛋 白质 组 学 和 D N A 芯 片 技 术 的 发 展 ，使 得 同 时 观 测 成 千 上 万 的 基 因 表 达 水 平 成 为 可 能 ，如 何 从 这 些 海 量 数 据 中挖 掘 出有 用 的 信 息 ，发 现 基 因 的 功 能 具 有 重 要 的研 究 意 义 。缺 失 值 处 理 和 聚 类 分 析 是 数 据 挖 掘 中 的关 键 步 骤 。 论 文 首 先 分 析 了 常 用 缺 失 数 据 处 理 方 法 的优 缺 点 ，针 对 K 一近 邻 (K N N ) 法 插 补 速 度 快 但 精 确 度 不 高 ，支 持 向量 回 归 (s V R ) 法 插 补 精 度 高 但 相 当 耗 时 等 不 足 ，采 用 K N N 与 S V R 相 结 合 的 方 法 实 现 缺 失 值 的 填 充 处 理 ，通 过 对 含 有 缺 失 值 的 酵 母 基 因 表 达 数 据 的 实 验 结 果 表 明 ，本 文 算 法 能 够 在 较 高 插 补 精 度 的 基 础 上 有 效 地 降低 插 补 时 间 。 其 次 ，论 文 针 对 现 有 基 因 表 达 数 据 聚 类 算 法 存 在 的 误 判 、聚 类 不 精 确 等 缺 点 ，利 用 支 持 向量 聚 类 算 法 (s V C ) 寻 找 最 优 分 类 超 球 实现 对 数 据 集 的有 效 划 分 ; 并 在 现 有 的基 于 类 内距 离 最 小 的 聚 类 有 效 性 评 估 准 则 的 基 础 上 ，提 出 了一 种 加 入 类 间信 息 的评 价 方 法 ，通 过 模 拟 退 火 算 法 寻 找 S V C 算 法 中 的最 优 核 函 数 参 数 和 惩 罚 因 子 ， 以使 聚 类 算 法 有 更 好 的推 广 能 力 。 对 酵 母 细 胞 生 长 周 期 的 表 达 数 据 集 的 仿 真 实 验 结 果 表 明 ， S V C 有 较 高 的 聚 类 精 度 ， 在 新 的 聚 类 算 法 有 效 性 评 估 标 准 下 ，模 拟 退 火 算 法 相 对 其 他 参 数 寻 优 法 ，能 够 更 快 更 好 地 得 到 最 佳 参 数 。 关 键 词 : 基 因 表 达 数 据 ; 缺 失 值 ; 聚 类 ; 支 持 向 量 回 归 : 支 持 向量 聚 类 么 西安 理 西安 理 工 大学硕 士 学位论 文 T it !G : T H E A N A L Y S IS A N D P R O C E S S !N G O F G E N E E X P R E S S IO N O 闰 rA M aj o r: C o n tro lT h e o ry C o n tro l E n g in e e rin g N am e:IVI in w U s ignature:从;。刃日 S u P e rv is o r : P ro f. D in g L IU 5 ig n a t u re : L e C t. R U ir U i J I 5 ign。ture :J 缸 皿 辽〔 ‘ 一 A b s t ra C t B io in fo rm at ie s 15 th e b rid g e e o nn e e tin g b io lo g ic a l d ata 丽 th m e d ie al se ie nt ifi e re se ar e h ， w hi eh 15 a n ew in terd isciP lin e ap P earin g w ith