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体外核酸诊断试剂盒引师物探针研发的基本流程
* 体外核酸诊断试剂盒引物探针研发的基本流程 体外核酸诊断试剂盒研发引物和探针的设计 检测病原体流行病学调查 病原体代表株系的全基因组序列比较 检测靶序列的确定 基于靶序列设计引物和探针 引物探针整体评分 靶序列数据库内特异性验证（NCBIclustal） Primer Premier 5评分（发夹，二聚体） Oligo6评价(基因组错配，二聚体验证) 靶序列空间结构预测（DNA fold） 引物探针是否合格 引物探针是否特异 Pick Primer评价 种间交叉反应评价 种内保守性评价 引物探针序列的确定 检测范围的确定 在我国内地主要流行A、B、C、D 4 种HBV 基因型, 所占比例分别为1. 2 %、39. 3 %、50. 2 %、8. 1 % ,并且各地区流行的基因型也存在较大差异,北方地区以C 型为主,约占81. 6 %;南方地区则以B 型为主,C 型也占相当比例（冯琴,杨桂英,朱善军等.乙型肝炎病毒基因分型的研究进展[J].医学检验与临床,2011,22(2):77,56. HBV流行病学调查：确定需要检测的分型以及靶序列 地区分型特点 分子生物学特征 Genes S, C, and P,region X, the precore region, and the pre-S2/pre-Sl regions were ranked in order of increasing variability.（Lauder I J, Lin H J, Lau J Y, et al. The variability of the hepatitis B virus genome: statistical analysis and biological implications[J]. Molecular biology and evolution, 1993, 10(2): 457-470. . 临床病理学 B 基因型的治疗反应、耐药发生率均优于C 型,HBV YMDD 突变株( YIDD/ YVDD) 多发生于基因型C和D（谢南, 朱小诚. 90 例 HBV 基因型与拉米夫定疗效的研究[J]. 实用临床医学, 2003, 4(4): 5-8. ） 地区分型特点 文献资料的检索 分子生物学特征文献资料的检索 临床病理学文献检索 病原体代表株系的全基因组序列比较 HBV（A,B,C,D）分型代表株系的全基因组序列比较 F P R Primer Premier 5评分（发夹，二聚体） Oligo6评价 上游引物 vs 下游引物 探针VS 下游引物 HBV基因组错配评价 空间结构 DNA folding form | /?q=mfold/dna-folding-form HBV引物在种内中间（针对中国地区以及其他地区ABCD代表分型）特异性评价 F P R F P R *
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