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图位克隆的基本原理和高方法1.pptVIP

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图位克隆的基本原理和高方法1

图位克隆的基本原理和方法;图位克隆的基本原理;;Primary mapping;作图群体; R/R;primary mapping method ;ZH11;找到紧密连锁的分子标记之后我们就要进行一个“阳性”检测:即检测这个找到的分子标记是不是真正的与目标性状连锁。 我们对F2代群体中随机选取一个200左右的小群体,将找到的分子标记分别扩增这些样,看表型与基因型是否对应。 同时我们可以用这个小群体进行一个初步的基因定位。;Fine mapping; R/R;ZH11:“A” ZS97:“B” 交换有两种带型:H和B;单株 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10;开发新的标记: 新的SSR标记: /modules/redbtools/ssrscan.php,运行SSRScan就会得到该段序列的简单重复序列。 InDel/Caps标记:将要开发标记的日本晴区段序列与93-11做一个blast,选取插入或者缺失比较大的位点设计引物。 SNPS标记:可??通过测序找到在ZH11/ZS97间存在单碱基差异的位点,或者找谢老师咨询。 ;Candidate gene;精细定位;找到候选基因后可对候选基因进行分析以排除非目标基因,可以通过比较扩增,测序,表达量检测及目标性状相关的生化和生理途径等方法来排除。当然最后要说明问题的话就是构建互补载体做一个互补验证。;

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