生物信息满学基础教程44.pptVIP

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  • 2019-01-18 发布于福建
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生物信息满学基础教程44

生物信息学基础教程 第4讲:正则表达式教程;本节内容;正则表达式;VIM教程;VIM编辑器;VIM编辑功能;VIM查找功能;grep教程;grep简介;grep用法;常用grep命令选项;grep正则表达式元字符;练习题:这些命令都能干啥?;sed教程;sed简介;sed用法;sed命令的选项;sed定位行号的方法;基本sed编辑命令;练习题:这些命令能干什么?;AWK教程;AWK简介;awk的三种执行方式;awk脚本的组成;awk脚本的运行机制;awk_pattern的格式;actions的格式;awk命令;awk语句;awk内部变量;awk自定义变量;awk内置函数;awk自定义函数;awk数组;避免awk错误的方法;2) 在awk中,设置有意义的变量名是一种好习惯,在进行模式匹配或关系操作时更容易理解。一般的变量名设置方式为name=$n 3) 通常在BEGIN部分给一些变量赋值是很有益的,这样可以在awk表达式进行改动时减少很多麻烦 4) awk的基本功能是根据指定规则抽取输入数据的部分内容并输出,另一个重要的功能是对输入数据进行分析运算得到新的数据并输出,这是通过在 awk_script中对字段变量($1、$2、$3...)重新赋值或使用更大的字段变量$n(n大于当前记录的NF)而实现的 5) 使用字符串或正则表达式时,有时需要在输出中加入一新行或查询一元字符。这时就需要

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