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软件编译与测试 编译软件： FFTW 极速傅立叶变换程序 LAMMPS 分子动力学模拟程序 测试算例： LAMMPS、NAMD 、CP2K ANSYS、FLUENT、CFX NASTRAN、MARC、DYTRAN、ACTRAN 精选 3，解压， ，在当前目录下生成fftw-3.3.3文件夹； 1，从网上下载fftw-3.3.3.tar.gz压缩包； ./configure --prefix=/vol6/home/cleng/cleng/fftw-3.3.3 --enable-shared --enable-sse2 --enable-float --enable-mpi tar –xvf fftw-3.3.3.tar.gz 2，通过ftp将文件上传至服务器指定目录下； ./configure --prefix=/vol6/home/cleng/cleng/fftw-3.3.3 make –j 8 make install 4， 进入该文件夹，开始安装： cd fftw-3.3.3 数学库安装fftw（以fftw-3.3.3为例） 安装完毕！ 注意：./configure --help按各自需求加关键词，如： 软件编译与测试 精选 [cleng@ln1 fftw-3.3.3]$ ls bin include lib share [cleng@ln1 lib]$ ls libfftw3.a libfftw3f_mpi.la libfftw3f.so libfftw3_mpi.a libfftw3f.a libfftw3f_mpi.so libfftw3f.so.3 libfftw3_mpi.la libfftw3f.la libfftw3f_mpi.so.3 libfftw3f.so.3.3.2 pkgconfig libfftw3f_mpi.a libfftw3f_mpi.so.3.3.2 libfftw3.la [cleng@ln1 lib]$ cd ../include/ [cleng@ln1 include]$ ls fftw3.f fftw3.h fftw3l-mpi.f03 fftw3-mpi.h fftw3.f03 fftw3l.f03 fftw3-mpi.f03 fftw3q.f03 软件编译与测试 编译完成后，查看是否在--prefix设定的目录下产生lib，include，bin等文件夹，并进入查看。 精选 软件版本： lammps-10Aug15 编译器：mpicxx（天河系统自带） 数学库：FFTW-3.3.4（网上下载） 并行通信实现：MPICH3.1.3 其他库：JPEG-8B（网上下载） 1，FFTW-3.3.4安装 ….如前所述，省略。 2，JPEG-8B安装 下载，解压，tar -xvf jpegsrc.v8b.tar.gz，产生jpeg-8b文件夹，在别的目录下新建一个文件夹JPEG，如路径为/vol6/home/cleng/cleng/lammps-10Aug15/jpeg 进入解压文件夹jpeg-8b，执行： ./configure --prefix=/vol6/home/cleng/cleng/lammps-10Aug15/jpeg make make install 精选 vi编辑器 vi提供三种操作模式:命令模式、插入模式、末行模式，三种模式可通过ESC键进行相互转换。 :q! 离开vi，并放弃刚在缓冲区内编辑的内容 :wq 将缓冲区内的资料写入磁盘中，并离开vi :x 同wq :w 将缓冲区内的资料写入磁盘中，但并不离开vi :q 离开vi，若文件被修改过，则会被要求确认是否放弃修改的内容 作业管理 精选 :set nu 设定资料的行号。 :set nonu 取消行号设定。 :10,20w test 将第10行至第20行的资料写入test文件。 :10,20wtest 将第10行至第20行的资料加在test文件之后。删除、复制及搬移。 :10,20d 删除第10行至第20行的资料。 :10d 删除第10行的资料。 :%d 删除整个编辑缓冲区。 :10,20co30 将第10