磁珠分离DNA技术检测HIV-1逆转录酶基因耐药性突变-生物通.PDF

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中国生物工程杂志 ChinaBiotechnology,2008,28(8):105~109 磁珠分离DNA技术检测HIV1逆转录酶基因 耐药性突变 2,3 1 1 1 1 程绍辉  何红秋  刘 斌  陈慰祖  王存新 (1北京工业大学生命科学与生物工程学院 北京 100022 2天津疾病控制与预防中心 天津 300031) (3天津市疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制所 天津 300011) 摘要 HIV1逆转录酶基因突变导致的耐药性严重影响了药物对病人的治疗效果,耐药性突变的 检测对于指导合理用药具有重要意义。发展了一种检测HIV1逆转录酶基因耐药性突变的新方 法,在两步 MSPCR方法的基础上,引入磁珠分离DNA技术并结合酶联免疫吸附检测方法 (ELISA)检测逆转录酶基因耐药性突变T215F和Y181C。结果显示:MSPCR结合磁珠分离技术 和ELISA具有较高的灵敏度和特异性,阳性/阴性比值(P/N值)达到要求,突变型模板检测限为 5%左右,耗时短且能进行高通量检测。无论在HIV1耐药性突变还是其它的点突变检测中,该方 法都具有较好的临床应用前景。 关键词 逆转录酶 耐药性突变 磁珠 ELISA MSPCR 中图分类号 Q819   高效抗逆转录病毒治疗法(highlyactiveanti 不但影响药物对病人的治疗效果,而且使新感染者可 retroviraltherapy,HAART)的推广使用,能够在一定程 能面临一经感染就无药可治的局面。因此,应当在治 度 上 控 制 由 人 类 免 疫 缺 陷 病 毒 (human 疗过程中定期监控以减少耐药突变的产生与传播。这 immunodeficiencyvirus,HIV)引起的人类获得性免疫缺 就要求有一系列操作简单、灵敏度和特异性较高的可 陷综合症(acquiredimmunodeficiencysyndrome,AIDS) 靠的耐药性检测方法。 [1,2]   HIV1耐药性检测方法分为基因型检测方法和表 的感染和传播 。但是,随着各种抗逆转录病毒药物 的使用,HIV耐药突变毒株不断出现并广泛传播,严重 型检测方法,基因型检测具有可提供交叉耐药资料、所 [3,4] 需的时间短(几天或几小时)、技术步骤少、费用较低等 影响了HAART的治疗效果 。耐药性突变通常以字 母数字字母的方式表达,第一个字母代表野生型病毒 优点,主要包括 DNA序列分析法和分子杂交分析 [5] 氨基酸残基,数字代表该残基在蛋白质中的位置,第二 法 。基于RTPCR扩增后的DNA测序方法被称为 [6] [3] HIV耐药性临床检测中的黄金标准 ,该方法准确性 个字母代表突变型病毒氨基酸残基 。例如:Y181C 表示病毒第 181位的氨基酸残基由野生型的酪氨酸 高,但对野生型和突变型混和毒株的检测时灵敏度较 (Tyr,Y)突变为亮氨酸(Cys,C),下文中的突变均以 低,而且成本较高。其它的基因型检测法如基因芯片 [7] 该方法表示。近年来,我国已经开始开展了对艾滋病 技术则受到灵敏度较低的限制 。 患者的大规模 HAART治疗,随着药物的广泛使用,耐   突变分离的 PCR(mutagenicallyseparatedPCR, [8]

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