中国沿海紫蛤属的系统发育-中国水产科学.PDFVIP

中国水产科学 2018 年9 月, 25(5): 936948 Journal of Fishery Sciences of China 研究论文 DOI: 10.3724/SP.J.1118.2018.17392 中国沿海紫蛤属的系统发育 蒋丽莎, 李琪, 孔令锋 中国海洋大学 海水养殖教育部重点实验室, 山东 青岛 266003 摘要: 紫蛤属(Sanguinolaria)贝类具有很高的经济价值, 长期以来却存在着物种鉴定错误、种名使用混乱、同物异 名等一系列问题, 关于其系统分类和演化问题的研究较少。为探究中国沿海紫蛤属的系统发育关系, 本研究利用两 个线粒体基因(COI 和 16S rRNA), 以及两个核基因(H3 和28S rRNA) 的部分序列, 对采自中国沿海紫蛤属3 亚属9 种紫蛤61 个个体进行系统发育分析。基于4 个基因片段联合数据集T12(剔除COI 第三位密码子位置)构建系统发 育树。结果表明, 两个线粒体基因片段GC 含量明显低于AT 含量, 表现出对AT 偏斜, 两个核基因表现出对GC 的 偏斜。4 个基因片段(COI 、16S rRNA、H3 和28S rRNA) 的颠换与转换比值分别为5.073、3.042 、1.564 和 1.480, 均 远高于系统分析的临界值0.4, 能够提供有效的系统发育信息。基于4 个基因片段的遗传多样性分析表明, 9 种紫蛤 均具有较高的核苷酸多样性(Pi0.05)与单倍型多态性(Hd0.5) 。基于 COI 基因片段的紫蛤属种内遗传距离为 0~0.016, 种间的平均遗传距离为0.087~0.331, 其中卵紫蛤(Sanguinolaria ovalis)与中国紫蛤(Sanguinolaria chinen- sis)遗传距离最小, 仅为0.087 。利用最大似然法(maximum likelihood, ML)和贝叶斯法(Bayesian inference, BI)构建 的系统发生树拓扑结构一致, 分化为3 大支, 与形态学分类的三个亚属分别对应。中国紫蛤和卵紫蛤在系统树上首 先聚为一支, 表明其亲缘关系最近。本研究结果阐明了中国沿海紫蛤属贝类的遗传多样性及其系统演化关系, 为紫 蛤属贝类种质资源的保护及可持续利用提供了科学依据。 关键词: 紫蛤属; COI; 16S rRNA; H3; 28S rRNA; 系统发育 中图分类号: S917 文献标志码: A 文章编号: 10058737(2018)05093613 紫蛤属(Sanguinolaria) 贝类隶属于软体动物 种紫蛤属贝类, 且将紫彩血蛤和张玺圆滨蛤定为 门 (Mollusca) 、双壳纲 (Bivalvia) 、帘蛤目 圆滨蛤属(Nutallia) 。由于传统分类主要依靠形态 (Venerioda) 、樱蛤总科(Tellinacea) 、紫云蛤科 特征, 而量化紫蛤属贝类某些形态学特征极其困 [1-2] [8-9] (Psammobiidae) 。我国已报道紫蛤属贝类 15 种 , 难(如壳色等), 且目前还没有形成统一的标准 , 该属贝类全部为海产, 肉质鲜美, 具有很高的经 因而造成鉴定困难或不准确。而系统分类和演化 济价值[3-4] 。目前, 国内外学者对紫蛤的生态生 问题由于缺乏遗传方面的研究至今尚未得到解决。 [5-7] 理、增养殖及药用价值开展了研究 。 近年来, 分子系统发生学的发展为解决紫蛤 长期以来, 我国一些紫蛤属物种存在物种鉴 属贝类系统分类和演化等问题提供了新的方法。 定错误、种名使用混乱、分类不明确等一系列问