栉孔扇贝等chlamysfarrericsnp的开发及其在单倍型构建中的应用.docx

栉孔扇贝(Chlamys角厂厂e厂，)cSNP的开发及其 栉孔扇贝(Chlamys角厂厂e厂，)cSNP的开发及其 在单倍型构建中的应用 学位论文完成日期： 指导教师签字： 答辩委员会成员签字： 独创 独创 声 明 本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我 所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究 成果，也不包含未获得 (洼i翅遗直基丝霞蔓挂型童盟笪!奎拦互窒2 或其他教育机构的学位或证书使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均 已在论文中作了明确的说明并表示谢意。 学位论文作者签名．墨闷抓签字吼办l J年6月2日 学位论文版权使用授权书 本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，并同意以下事项： l、学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借 阅。 2、学校可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印 或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同时授权清华大学“中国学术期刊(光盘版)电子杂志 社用于出版和编入CNKI《中国知识资源总库》，授权中国科学技术信息研究所将本学位论文 收录到《中国学位论文全文数据库》。(保密的学位论文在解密后适用本授权书) 学雠文储虢甬貅 翮酶 、W 签字日期：必I f年‘月7--日 签字日期：≯，1年6月1日 e e of and probes are designed for candidate sites．Two hundred and fifty—nine pairs of primers are amplied successfully,which take account for 65．8％of all the designed．The sizes of products between 70 bps and 900 bps，and then primers of products between 70 bps and 1 50 bps are picked．Six individuals are used for testing validation of probes，getting 1 0 1 sites for genotyping later． Consequently，44 cSNPs(exclude i_add)are identified following high resolution melting(HRM)by taking 48 representative unrelated individuals，which orignate from 5 populations．Forty-eight individuals from Qingdao population are utilized for charactering．Over all,HE range from 0．100 to 0．505凰distribute from O．1 042 to 0．875．Four of analyses exhibited non-Mendelian segregation ratios before Bonferroni correction，with O．8％significant after correction．demonstrating that SNPs markers can be considered Mendelian traits．There are 40 loci conformed to Hardy-Weinberg equilibrium，which are useful for many studies．灿1 the 44 loci are bi—allelic loci including 34 transition and 1 0 transversion．These results suggest that the transcriptome of Zhikong scallop has relatively high degree of variation．These markers are potentially useful for evaluation of genetic diversity and population structure of Zhikong scallop． 2．Construct i on of Hap I otype US i ng SNPs In this part，SNPs are used to haplot