合成生物学技术在聚羟基脂肪酸酯PHA生产中的应用.pdf

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合成生物学技术在聚羟基脂肪酸酯PHA生产中的应用

中国科学: 生命科学 2015 年 第45 卷 第10 期: 1003 ~ 1014 《中国科学 》杂志社 SCIENTIA SINICA Vitae SCIENCE CHINA PRESS 评 述 中国科学院学部 科学与技术前沿论坛 合成生物学专辑 合成生物学技术在聚羟基脂肪酸酯 PHA 生产中的应用 王颖, 陈国强* 清华大学生命科学学院, 清华大学-北京大学生命科学联合中心, 教育部生物信息学重点实验室, 北京 100084 * 联系人, E-mail: chengq@ 收稿日期: 2015-03-12; 接受日期: 2015-04-06 国家重点基础研究发展计划(批准号: 2012CB725201)和国家自然科学基金(批准号:资助 doi: 10.1360/N052015-00042 摘要 合成生物学的迅猛发展使其在各个领域得到了广泛应用, 底盘设计、元件组装、代谢 关键词 网络的从头构建、大片段DNA 克隆、多片段DNA 拼接等合成生物学技术的开发和利用大大提 PHA 合成生物学 高了工业生物技术的竞争力. 聚羟基脂肪酸酯(PHA)是一种具有生物可降解和生物相容性等优 代谢工程 良特性的生物塑料, 可以在许多细菌胞内合成, 已经被开发应用于多个领域. 但是, PHA 高昂的 生物材料 生产成本阻碍了其大规模应用. 基于合成生物学研究而得到的新方法、新技术可以改变细菌生 长模式、生长条件以及细菌形态, 从而进一步降低 PHA 的生产成本. 另一方面, 通过改造细菌 基因组如弱化-氧化途径可以得到不同种类的重组菌株, 用于生产具有不同性能的包括无规共 聚物、嵌段共聚物、带有官能团的聚合物等在内的新型多功能PHA 材料. 合成生物学的应用开 创了低成本、高附加值的PHA 材料生产的新时代, 为PHA 的产业化奠定了坚实的基础. 聚羟基脂肪酸酯(polyhydroxyalkanoates, PHA)是 (4-hydroxybutyrate, 4HB)、3-羟基十二酸(3-hydroxy- 一种结构多样化、生物可降解的高分子聚合物, 可以 dodecanoate, 3HDD)等[6,7]. 由此形成多种PHA, 包括 由多种微生物合成, 一般作为其体内碳源和能源的 由单一单体聚合而成的均聚物和由两种或两种以上 储存物质存在[1~3]. 在微生物体内, PHA 以疏水性颗 单体形成的共聚物, 其中共聚物又可分为无规共聚 粒的形式存在, 在积累量高的细菌体内, PHA 含量可 物和嵌段共聚物等, 常见的有聚 3-羟基丁酸-4-羟基 以达到80% 以上[4]. PHA 可以完全由生物合成并具有 丁酸酯 P(3HB-co-4HB)[8,9] 、聚 3-羟基丁酸-3-羟基戊 与来源于石油的化工类塑料相似的材料性质, 此外, 酸酯 poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate, PHA 具有生物可再生、生物可降解、生物相容性好 P(3HB-co-3HV)、聚3-羟基己酸-3-羟基辛酸酯poly(3- 等优良特性, 被认为是解决“ 白色污染” 的一种“绿色 hydroxyhexanoate-co-3-hydroxyoctanoate, P(3HHx-co- 塑料”[1,5]. 聚合形成 PHA 的单体非常多样化, 如 3- 3HO)、聚3-羟基丙酸-4-羟基丁酸酯poly(3- hydroxy- 羟基丁酸(3-hydroxybutyrate,

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