BIOLOG在土壤微生物群落功能多样性研究中应用1.pdfVIP

维普资讯 第 41卷 第 3期 土 壤 学 报 Vo1．41，No．3 2004年 5月 ACTA PEDOLOGICA SINICA May，2004 BIOLOG在土壤微生物群落功能多样性 研究中的应用* 郑 华 欧阳志云干 方治国 赵同谦 (中国科学院生态环境研究中心系统生态重点实验室 ，北京 100085) 摘 要 微生物功能多样性信息对于明确不同环境中微生物群落的作用具有重要意义 ，而微生物群 落的定量描述一直是微生物学家面临的最艰 巨的任务之一。 目前，以群落水平碳源利用类型为基础的 B10LoG氧化还原技术为研究土壤微生物群落功能多样性提供 了一种简单 、快速 的方法 ，并得 以广泛应用。但 它仍然是一种以培养为基础的方法 ，显示 的代谢多样性类型也不一定反映整个土壤微生物群落 的功能多样 性。因此 ，这种方法优点明显 ，缺陷也存在 ，并且在应用过程中还有很多关键 的操作要点与技巧。本文综述 了 BIOLOG研究土壤微生物群落功能多样性的原理 、BIOLOG研究土壤微生物群落功能多样性的方法与技巧 、应 用过程 中容易产生的问题及可能克服的办法，同时还提出了值得进一步研究的问题。旨在促进对 BIOLOG测 定土壤微生物群落功能多样性 的了解 ，为正确运用这种方法开展土壤微生物群落功 能多样性研究提供科 学 依据和理论指导。 关键词 BIOLOG；土壤微生物群落 ；功能多样性 中图分类号 S714．6 文献标识码 A 微生物功能多样性信息对于明确不同环境中微 物群落的一部分 ，这种代谢多样性类型也就不一定 生物群落的作用具有重要意义…。而平板上肉眼计 反映整个土壤微生物群落的功能多样性_6I】 ，因 数的分类技术只检测到环境样品中的一小部分微生 此许多研究者对此方法 的利与弊及其准确性 、重现 物使得微生物群落的定量描述成为微生物学家面临 性开展了广泛研究 ，本文对这种方法应用于土壤微 的最艰巨的任务之一_2』。目前 ，有两种方法在此研 生物研究的进展和应用技巧作一综述 ，旨在促进对 究领域中得 到认可：利用微生物 rRNA(rDNA)和环 BIOLOG测定土壤微生物群落功能多样性的了解 ，为 境样 品中磷酸脂肪酸分析微生物群落功 能多样 正确运用这种方法开展土壤微生物群落功能多样性 性_3J。但是这两种方法要求的劳动强度大、时间长 、 研究提供科学依据和理论指导。 技术含量较高，难 以在较短的时间内分析较多的样 品，以BIOLOG微孔板碳源利用为基础 的定量分析 1 BIOLOG研究土壤微生物群落功能 为描述微生物群落功能多样性提供 了一种更为简 多样性的原理 单、更为快速的方法llI4 J，并广泛应用于评价土壤 微生物群落的功能多样性 ：不同土壤类型l9J、不同植 BIOLOG研究微生物 的载体是微孔板 (Mi． 物物种 下 的土壤ll、不 同管理策 略下 的农业土 croPlate)，每板包含 96个孔 ，其 中95个孔中加入 了 壤_l 和不同植被的根际土壤_l。但这种方法存 95种单一碳源和四唑染料 ，另外一个未加碳源的孔 在选择培养问题 ，只有能够利用 BIOLOG微孔板上 中加水作为对照。微生物接种 到微孔板上的孔 中 碳源的微生物才能反映出来，也只代表了整个微生 后，孔中的微生物就可能利用其中的碳源而发生氧 * 中国科学院知识创新工程重要方 向项 目(KZCX3．SW．424)、国家重点基础研 究发展规划项 目(G2000046