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课件资源蛋白质的分子结构
?-pleated sheet ?-折叠结构要点 ①多肽链充分伸展,相邻肽单元之间折叠成锯齿状结构,侧链位于锯齿结构的上下方。 ②两段以上的β -折叠结构平行排列 ,两链间可顺向平行,也可反向平行 。 ③两链间的肽键之间形成氢键,以稳固β -折叠结构。氢键与螺旋长轴垂直。 Pro存在处往往形成β-转角。 3. ?-转角 ?-转角: ?-转角结构要点: ① 肽链内形成180o回折。 ②含4个氨基酸残基,第一个氨基酸残基与第四个形成氢键。 ③ 第二个氨基酸残基常为Pro。 没有确定规律性的肽链结构 4.无规卷曲 模体是具有特殊功能的超二级结构 在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个有规则的二级结构组合,被称为超二级结构。 二级结构组合形式有3种: αα,βαβ,ββ 二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,称为模体(motif) 。 模体是具有特殊功能的超二级结构。 α-螺旋-β转角(或环)-α-螺旋模体 链-β转角-链模体 链-β转角-α-螺旋-β转角-链模体 模体常见的形式 钙结合蛋白中结合钙离子的模体 锌指结构 模体常见的形式 锌指结构 三、在二级结构基础上多肽链进一步折叠形成蛋白质三级结构 疏水键、离子键、氢键和 Van der Waals力等。 主要的化学键: 整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。 定义: (一)三级结构是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置 肌红蛋白 (Mb) N 端 C端 纤连蛋白分子的结构域 (二)结构域是三级结构层次上的局部折叠区 分子量较大的蛋白质常可折叠成多个结构较为紧密的区域,并各行其功能,称为结构域 (domain) 。 亚基之间的结合主要是氢键和离子键。 四、含有二条以上多肽链的蛋白质具有四级结构 蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。 有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链,每一条多肽链都有完整的三级结构,称为蛋白质的亚基 (subunit)。 胰岛素受体:由4个亚基组成(α2β2) ,α亚基与β亚基形成单体(monomer),2个单体形成二聚体(dimer)。 由2个亚基组成的蛋白质四级结构中,若亚基分子结构相同,称之为同二聚体(homodimer),若亚基分子结构不同,则称之为异二聚体(heterodimer)。 血红蛋白的四级结构 4 subunits 血红蛋白的四级结构 血红蛋白的四个亚基紧密结合,亚基之间的维系键是亚基之间的8个盐键 * 生物化学与分子生物学 王顺 副教授 辽宁医学院基础医学院 生物化学与分子生物学教研室 蛋 白 质 的 分 子 结 构The Molecular Structure of Protein 第 二 节 蛋白质的分子结构包括: 一级结构 (primary structure) 二级结构 (secondary structure) 三级结构 (tertiary structure) 四级结构 (quaternary structure) 高级结构 定义: 蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序。 一、蛋白质的一级结构 主要化学键:肽键 二硫键的位置属于一级结构研究范畴。 胰岛素的一级结构 30 21 一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础,但不是决定蛋白质空间构象的唯一因素。 二、多肽链的局部主链构象为蛋白质 二级结构 蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象 。 定义: 主要的化学键:氢键 (一)参与肽键形成的6个原子在同一平面上 参与肽键的6个原子C?1、C、O、N、H、C?2位于同一平面,C?1和C?2在平面上所处的位置为反式(trans)构型,此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元 (peptide unit) 。 由于C=O双键中的π电子云与N原子上的未共用电子对发生“电子共振”,使肽键具有部分双键的性质,不能自由旋转。 蛋白质立体结构原则 0.151nm 0.146nm ?-螺旋 (? -helix) ?-折叠 (?-pleated sheet) ?-转角 (?-turn) 无规卷曲 (random coil) (二)α-螺旋结构是常见的蛋白质二级结构 蛋白质二级结构 1. ?-螺旋 ?-螺旋 结构要点: ①多肽链主链围绕中心轴形成 右手螺旋,侧链伸向螺旋外侧。 ②每圈螺旋含3.6个氨基酸,螺距为0.54nm。 ③每个肽键的亚氨氢和第四个肽键的羰
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