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核酸制备电泳仪Sage Science Pippin
一、样品前处理准备
(1)样品处理:DNA 样品必须是去蛋白的,用TE 缓冲液或ddH2 O 溶解
(2 )30ulDNA 样品+10ul 上样缓冲液,震荡离心,混合均匀
(3 )确认DNA 片段大小及回收范围
(4 )缓冲液要提前放到室温下,以免影响电流的连续性
二、仪器控制软件界面
(1)Main 主界面
①泳道从下之上1-5 个,在Sample ID 填写每个泳道中加入样品的名称
②Protocol Name 运行程序名称,可调用已编写好的运行程序
③Progress 程序运行进度
④Voltage 电压设置,默认值为1.2V
⑤Clock 系统日期和时间,可在System Options 界面进行更改和设置
⑥“TEST ”按钮,将预制胶板放置在卡槽内,检查连续性
⑦点击 “START”按钮,开始运行程序,点击“PAUSE ”按钮,暂时中止运行的程序
⑧光学校正板放置在卡槽内,点击 “CALIBRATE ”按钮,进行光学矫正
⑨点击“INFO ”,仪器信息及仪器使用说明书
⑩点击 “SHUTDOWN”,关闭显示器及仪器
(2 )Protocol Editor 程序编写界面
①Cassette 设置,根据所使用的预制胶类型选择,本机配备的预制胶为2 % DF Marker V1
②“Run time” ,运行时间设置
③鼠标点击“Tight ”后,Target 框可进行手动填写,例如填写300bp 表示回收的DNA 片段为
300bp 左右, “Start”和 “End ”框自动出现数值,例如270bp ,330bp,表示回收的DNA 片
段范围270~330bp 。鼠标点击“Range ”框,“Start”和“End ”框可手动填写数值,表示回
收DNA 片段范围,Target 框自动出现数值。Sample ID Template 填写泳道加入样品的名称。
“Range Flag ”显示tight/narrow/broad 3 种,表示DNA 片段回收范围大小。
④Reference lane 回收较大的DNA 片段(600bp 以上),需要选择1-5 任一个泳道作为参考泳
道,加入40µl Marker ,同时需要点击“APPLY REFERENCE TO ALL LANES ”按钮
1
⑤回收较小片段时(100~600bp),Reference lane 设置为 off ,同时点击“USE INTERNAL
STANDARDS”按钮,选择使用内标
⑥ “NEW ”新建运行程序,“LOAD ”调用已编写好的程序
⑦设置完成,点击“SAVE AS”按钮,给程序命名,将编写好的程序存储在指定的路径下,
以备下次调用
(3 )Log Review 查看已运行程序信息
①点击“LAST ”旁边的文件夹图标,选择需要查询程序的名称,点击“OK ”按钮,在Log Review
界面出现已运行程序信息
②Log File 文件路径及名称,Instrument ID 仪器名称,Protocol Name 程序名称,Cassette Name
所使用的预制胶规格,Run time 运行时间,End Run when elution is completed 勾选上:洗脱完
成结束程序运行。Ref lane 参考泳道。Target/Start/End 分离DNA 片段范围信息。Range Flag
分离DNA 片段范围状态,波形图:泳道运行时间(X 轴)~光信号或泳道电流信号(Y 轴)
(4 )File manager 文件管理界面
①点击 “Go To LOGS ”,查看以日期命名的文件下的文件
②点击“Go To PROTOCOLS ”,查看已运行的文件
③点击“Go To CASSETTES ”查看各种预制胶规格
(5 )System Options 系统设置界面,可对仪器进行命名,对系统的日期和时间进行设置
三、编程
①根据所需目的片段大小选择预制胶种类,例如,100-600bp 用2%agarose+V1
②小片段 (100~600bp)选择内标internal standards ,不需要设置参考泳道;大片段选择外标
Marker ,需要设置一个参考泳道
③设置回收方式和片段区域大小,设置运行时间,默认选择“洗提完成后终止” 。
四、光学校正CALIBRATE
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