岳海梅藏东南地区毛壳属真菌多样性及系统发育分析.pdfVIP

浙江大学学报（农业与生命科学版） 43（4）：431～440，2017 JournalofZhejiangUniversity(Agric.LifeSci.) /agr E-mail:zdxbnsb@ DOI:10.3785/j.issn.1008-9209.2016.12.221 藏东南地区毛壳属真菌多样性及系统发育分析 1* 2 3 11 岳海梅 ，庄华 ，潘朝晖 ，巩文峰 （1.西藏农牧学院植物科学学院，西藏林芝 860000；2.西北农林科技大学植物保护学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室，陕西杨凌 712100；3.西藏高原生态研究所，西藏林芝860000） 摘要 为分析藏东南地区毛壳属（ChaetomiumKunze）真菌多样性及系统发育情况，从藏东南5个市、县采集土壤、 植物残体和动物粪便等标本共355份，采用组织分离法和稀释分离法得到36株毛壳菌，平均分离几率为10.14%。 将分离得到的菌株进行多样性指数特征分析，并按形态特征初步分类；运用聚合酶链式反应对菌株的rDNA-ITS和 β-tubulin基因序列进行扩增与序列测定；利用MEGA5.0软件构建rDNA-ITS和β-tubulin基因系统发育进化树。结 果显示：林芝县的毛壳属真菌多样性指数最高，为1.1785，物种均匀度指数也最高，为0.6056；昌都市的毛壳属真菌 丰富度指数最高，达到0.8614。不同地区毛壳属真菌的优势种也存在差异：工布江达县的优势种为球毛壳（C. globosum）；墨脱县和昌都市的优势种为粪生毛壳（C.funicola）；察隅县的优势种为旋丝毛壳（C.bostrychodes）；林芝 县的优势种为反卷毛壳（C.convolutum）。根据形态特征可将36株菌归属为8个种。分析扩增后的rDNA-ITS和 β-tubulin基因序列发现，β-tubulin基因的变异位点、单倍型总数、单倍型多样度、核苷酸多样性指数和核苷酸平均 差异数与rDNA-ITS序列的这些参数存在显著差异，体现出更大的碱基变异性。系统发育进化树表明，供试的36个 菌株被分为7个组，rDNA-ITS和β-tubulin这2个基因片段不仅可用来区分毛壳菌属中形态差异较大的种，如印度 毛壳（C.indicum）、大果毛壳（C.megalocarpum）、球毛壳（C.globosum）、粪生毛壳（C.funicola），还可区分形态特征非 常相似的印度毛壳（C.indicum）和直立毛壳（C.erectum），同时也可以对一些形态上难以鉴定的种进行初步鉴定，但 不能较好地区分反卷毛壳（C.convolutum）、旋丝毛壳（C.bostrychodes）和黑毛壳（C.nigricolor），需要结合更多的基因 片段进行区分。综上所述，本文对藏东南地区毛壳属真菌多样性与系统发育情况进行了研究，为丰富西藏毛壳属 真菌资源和开发毛壳菌代谢产物奠定了理论基础。 关键词 藏东南；毛壳菌；多样性；系统发育分析 中图分类号 Q949.32 文献标志码 A Diversityandphylogeneticanalysisof Chaetomium fungusfromsoutheasternTibet. Journal of ZhejiangUniversity(Agric.LifeSci.),2017,43(4):431-440 1* 2 3 1 YUEHaimei ,ZHUANGHua,PANZhaohui,GONGWenfeng (1.DepartmentofPlantScience,TibetAgriculturaland AnimalHusbandryCollege,Linzhi 860000,Xizang,China;2.CollegeofPlantProtection,NorthwestAFUniversity/State KeyLaboratoryo