第十三章真菌分类学地位(普通真菌学).pptVIP

第十三章 真菌在生物界的地位及其分类 第一节 真菌在自然界的地位 第二节 真菌的分子生物学鉴定方法 1 真菌DNA碱基组成的分类鉴定方法 2 核酸分析技术 3 真菌核型的脉冲电泳分析 第三节 真菌的起源和演化 第四节 真菌的命名和分类 两界系统（1753）：植物界和动物界 三界系统(1860)：原生生物界（藻类、原生动物、细菌和真菌）植物界和动物界 四界系统(1938、1956、1959)：原生生物界（蓝藻、原生动物和细菌）、真菌界、植物界和动物界 五界系统（1969）：原核生物界（蓝藻和细菌）、原生生物界（单细胞真核生物）、真菌界、植物界（高等藻类绿藻和红藻）和动物界 八界系统（1981，1988）1995年《真菌字典》（第八版）接受了8个界的系统： 原核生物界、原生动物界、胆藻界、真菌界、眼虫动物界、藻物界、动物界、绿色植物界。 两总界（1965）：始生总界（无细胞形态的病毒）和胞生总界（细菌、黏菌、真菌、植物、动物） 三域（1971）：病毒域、原核域和真核域 真菌界(五界系统) Introduction to Mycology,1979 真菌界 分子系统学和超微结构的深入研究，发现卵菌、丝壶菌、粘菌、根肿菌等在亲缘关系上与真菌较远，而地衣与真菌亲缘关系较近。 本书采用的分类系统 Smith（1981，1988）提出的生物8界系统，即原核生物界、原生动物界、胆藻界、真菌界、眼虫动物界、藻物界、动物界、绿色植物界。 真菌界：壶菌门、接合菌门、子囊菌门、担子菌门、半知菌类 壶菌门——壶菌纲 接合菌门——接合菌纲、毛菌纲 子囊菌门——半子囊菌纲、不整囊菌纲、核菌纲、腔菌纲、盘菌纲、虫囊菌纲 担子菌门——冬孢纲、层菌纲、腹菌纲 半知菌门——芽孢纲、丝孢纲、腔孢纲 第二节 真菌的分子生物学鉴定方法 一、真菌DNA碱基的分类鉴定 通过测定不同真菌DNA的四个碱基中A、G、C、T的组成来鉴定真菌，在真菌分类中有两个作用 1、可以鉴定真菌的种、属 2、可以作为判定真菌科属间的亲缘关系的参考标准 1、基于Southern杂交技术的分子标记 利用限制性内切酶酶解及凝胶电泳分离不同的生物DNA分子,然后用经标记的特异DNA探针与之进行杂交,通过放射自显影或非同位素显色技术来揭示DNA的多态性,主要有RFLP和VNTR。 1）RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)限制性片段长度多态性 检测DNA在限制性内切酶酶切后形成的特定大小的DNA片段。由于不同来源DNA的特定的限制性内切酶酶切位点分布不同,每一种DNA与限制性内切酶酶切所产生的片段大小都是特异的,从而产生多态性。 研究表明RFLP可有效地检测植物病原真菌的种内遗传分化,可用于区分病原真菌的近缘种、小种、专化型,也可用于比较不同地理区域病原的群体遗传结构及病害的流行趋势。 2）VNTR(Variable Number of Tandem Repeats)串联重复变异值 真核生物DNA存在大量的串联重复序列的高变异区,可采用VNTR标记技术区分小卫星或微卫星序列的差异。VNTR基本原理与RFLP大致相同,但要求限制性内切酶的酶切位点必须不在重复序列中,以保证小卫星或微卫星的序列的完整性, 通过电泳可充分显示不同长度重复序列片段的多态性。分子杂交所用DNA探针核苷酸序列也必须是小卫星或微卫星序列。 1)　RAPD(Randomly Amplified Polymorphic DNA)随机扩增多态性DNA分析 RAPD基本原理是利用随机引物(一般为8-10bp)通过PCR反应非定点扩增DNA片段,然后用凝胶电泳分析扩增产物DNA片段的多态性。 RAPD适合于种内菌株遗传多样性、亲缘关系的研究,是真菌种鉴定有效可靠的工具,近几年得到了大量的应用,但对于种间及近缘属之间的亲缘关系的研究有一定的局限性。 2)SSR标记(Simple Sequence Repeats,又微卫星micro satellite又RAMS) SSR标记是利用真核生物基因组中存在的大量重复序列(微卫星序列)设计引物,通过PCR扩增串联的重复序列，依据微卫星寡核苷酸的重复次数在同一物种不同基因型间的差异，揭示长度多态性，是目前研究遗传变异的较好方法。 朱振东等从大豆疫霉菌ESTs中发掘并建立了大豆疫霉菌的SSR标记,为大豆疫霉菌及相关属种的鉴定、遗传变异、分子作图等研究提供了一种更加有效的分子标记系统。 3)ISSR(inter-simple sequence repeats polymorphism)简单重复序列间多态性 ISSR标记技术利用真核生物基因组中广