N26G600生物资料整合与分析.PDFVIP

N26G600 生物資料整合與分析 吳謂勝授課 課程大綱 • 生物背景知識介紹 • 各種生物資料介紹 • 需整合各種生物資料的研究主題介紹 • 兩人一組選定題目當做期末project • 報告研究主題之經典論文 • 用我建議的或是自己提出的新方法進行研 究 • 執行研究得到成果寫成論文期末報告 • 演算法必須包裝到網頁的介面裡讓使用者 可以access • MYBS: a comprehensive web server for mining transcription factor binding sites in Yeast • .tw/~mybs/ • 交大黃憲達 • .tw/~bryan/ • Nucleic Acids Research (IF 6.9) • Database issue (every Jan.) • Webserver issue (every July) 評分標準 • 期中必須先會做出網頁介面(PHP, Perl, Html, Python, Java,…) • 報告經典論文 • 報告我建議或是你們自己想出來的演算法 • 寫程式implement algorithm • 將程式包裝成網頁介面 • 將研究成果寫成論文(投稿期刊可當碩博士畢業 論文) • 期末demo 程式補救課程 • 電機所N2197N26G400碩博 N生物資訊程 式設計選修3張天豪57 [3]6~8電機系館92371 • 生資所Z2006Z260600碩 N網際資料庫專 論選修3 曾大千15 [2]5~7儀器設備大樓95A021 • 課程簡介 • 介紹基因晶片實驗資料 • 介紹免疫沉析晶片實驗資料 • 介紹蛋白質交互作用實驗資料 • 介紹大規模基因突變實驗資料 • 介紹轉錄因子結合序列實驗與預測資料 • 介紹如何整合各種不同的生物資料 • 介紹離散隨機動態系統模型 • 介紹最大概率參數估測法 • 介紹如何結合各種生物資料以進行重要生物問題研究 • 重建基因調控網路 • 偵測參與重要生化反應的轉錄因子 • 重建蛋白質交互作用網路