赖氨酸胍基化对蛋白质组分析的影响-中国科学院大连化学物理研究所.PDF

2014 年4 月 Ｖｏｌ． 32 Ｎｏ．4 Ａｐｒｉｌ 2014 Chinese Journal of Chromatography 376~380 庆祝《色谱》创刊三十周年暨卢佩章院士九十华诞专刊研究论 ＤＯＩ ：10．3724／ ＳＰ．Ｊ． 1123．2014．01003 赖氨酸胍基化对蛋白质组分析的影响 1，2 1，2 1，2 1，2 郑 昊 ， 毛家维 ， 潘彦博 ， 刘忠山 ， 1，2 1* 1* 刘哲益 ， 叶明亮 ， 邹汉法 （1． 中国科学院分离分析化学重点实验室，国家色谱研究分析中心，中国科学院大连化学物理研究所， 辽宁大连 116023；2． 中国科学院大学北京 100049） 摘要：赖氨酸胍基化在蛋白质组学定性和定量研究中起着重要作用，本文系统分析了胍基化前后，ＨｅＬａ 细胞蛋白 质经胰蛋白酶酶解产生的 3种不同类型肽段的质谱鉴定情况，并探讨了不同肽段质谱响应改变的内在原因。发现 赖氨酸在侧链能选择性地发生胍基化反应（其选择性达到 96.8％ ），转化为高精氨酸，碱性增强。因此在正离子质 谱模式下，Ｃ 端为赖氨酸的肽段产生了更多的 ｙ 离子，提供了许多新的离子碎片信息。在鉴定结果中，此类肽段所 占总肽段的比例由原来的51.7％ 上升为 57.3％ ，并且有1015条新的肽段被检测到。对于不含有赖氨酸的肽段，其 鉴定结果在胍基化前后基本没有变化。结果表明，胍基化可以在一定程度上提高质谱鉴定的灵敏度和互补性，提 高蛋白质分析的覆盖率。 关键词：质谱；蛋白质组学；胍基化；肽段碎裂 中图分类号：Ｏ658 文献标识码：Ａ 文章编号：1000 8713（2014）04 0376 05 Ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｔｈｅ ｌｙｓｉｎｅ ｇｕａｎｉｄｉｎａｔｉｏｎ ｏｎ ｐｒｏｔｅｏｍｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ＺＨＥＮＧ Ｈａｏ 1，2 ，ＭＡＯ Ｊｉａｗｅｉ 1，2 ，ＰＡＮ Ｙａｎｂｏ 1，2 ，ＬＩＵ Ｚｈｏｎｇｓｈａｎ 1，2 ， ＬＩＵ Ｚｈｅｙｉ 1，2 ，ＹＥ Ｍｉｎｇｌｉａｎｇ 1* ，ＺＯＵ Ｈａｎｆａ 1* （1． Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｓｅｐａｒａｔｉｏｎ Ｓｃｉｅｎｃｅ ｆｏｒ Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｉｃ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｃｅｎｔｅｒ ，Ｄａｌｉａｎ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｐｈｙｓｉｃｓ ，Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ，Ｄａｌｉａｎ 116023，Ｃｈｉｎａ ； 2． Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅ ，Ｂｅｉｊｉｎｇ 100049，Ｃｈｉｎａ ） Ａｂｓｔｒａｃｔ ：Ｔｈｅ ｇｕａｎｉｄｉｎａｔｉｏｎ ｏｆ ｌｙｓｉｎｅ ｓｉｄｅ ｃｈａｉｎ ｗａｓ ｐａｉｄ ｇｒｅａｔ ａｔｔｅｎｔｉｏｎ ｉｎ ｒｅｃｅｎｔ ｙｅａｒｓ． Ｉｔ ｐｌａｙｓ ａｎ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｒｏｌｅ ｉｎ ｑｕａｌｉｔａｔｉｖｅ ａｎ