龙眼miR166家族的分子进化特性及时空表达分析.PDF

龙眼miR166家族的分子进化特性及时空表达分析.PDF

龙眼miR166家族的分子进化特性及时空表达分析

园艺学报,2017 ,44 (12) :2285 –2295. Acta Horticulturae Sinica doi :10.16420/j.issn.0513-353x.2017-0073;http ://www. ahs. ac. cn 2285 龙眼 miR166 家族的分子进化特性及时空表达 分析 林玉玲,张清林,曾友竞,陈晓慧,张梓浩,陈裕坤,赖钟雄* (福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州 350002 ) 摘 要:为了解 miR166 基因家族的分子进化特性及其在龙眼不同组织部位的表达规律,对龙眼 miR166 家族成员的成熟体和前体序列及其进化、前体二级结构预测、靶基因预测以及时空表达模式进行 了分析。结果表明:龙眼 miR166 家族含有 12 条成熟体序列和 7 个前体序列(pre-miRNA )。Mfold 预测 显示 pre-miR166 家族 7 个成员的序列均能形成典型稳定的茎环二级结构,成熟序列的碱基保守性高,其 他位置的则保守性减弱;它们的最小折叠自由能(ΔG )在–35.30 ~ –83.30 kal · mol-1 。系统发育进化树

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