3.基于质谱的蛋白质相互作用研究方法 靶蛋白制备 蛋白质复合体的纯化 蛋白质复合体的质谱鉴定 基本步骤: (1)亲和层析耦联质谱技术 (2)免疫共沉淀耦联质谱技术 (3)生物传感器耦联质谱技术 (4)串联亲和纯化耦联质谱技术 (五)蛋白质组学研究的生物信息学 生物信息学是蛋白质组学研究的一个不可缺少的部分。 构建和分析双向凝胶电泳图谱 数据库的搜索与构建 应 用 蛋白质组数据库是蛋白质组研究水平的标志和基础 瑞士的SWISS-PROT拥有目前世界上最大、种类最多的蛋白质组数据库。 目前应用最普遍的数据库是NRDB 和dbEST数据库。 NRDB数据库 是由NCBI创建的,是NCBI的BLAST搜索程序的默认蛋白质序列数据库 该数据库是一个较完全的,包含最新信息的数据库。 dbEST数据库 由美国国家生物技术信息中心(NCBI)和欧洲生物信息学研究所(EBI)共同编辑,包括许多生物体的表达序列标签(EST) 肽序列标签(PST)或部分序列信息最适合查寻 数据库 说明 WWW地址 蛋白质序列库: SWISS-PROT 内容丰富,提示详尽
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