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* 识别螺旋嵌入DNA大沟中 非特异性结合, 结合部位附近的正电区,与PO43-产生静电作用 特异性结合,aa与DNA结合的界面形成大量氢键 * * 有3个?—helix,H1与H2平行 H2与H3形成HTH motif H3位于大沟中,与DNA特异结合 N末端位于小沟中,与DNA接触 homeotic loci 目前已知具有同源结构域的真核生物蛋白质近百种,其中都存在HTH结构 180bp, 60aa 从酵母到人类都存在homeobox, DNA序列高度保守 参与调控 * F-----Phe L---Leu Y-----Tyr * * Zn指可以形成α-螺旋插入到大沟中,而另一面为β-折叠 Berg 等认为,锌指的三维结构可能包括一个?—折叠和?—螺旋 * Glucocorticoid--[生化]糖(肾上腺)皮质激素 estrogen--[生化]雌激素 * MyoD基因家族成员以肌肉特异性基因转录激活物的形式发挥作用[1],它们具有bHLH结构域,与肌肉特异性基因调控区常见的顺式作用元件E-box结合。当然,需要提及的是,除了bHLH结构域外,转录机制的激活还需要位于NH2-和COOH-末端的非保守性的反式激活结构域的参与[2]。MyoD基因编码核DNA结合蛋白(nuclear DNA-bingding protein),能够与肌肉特异性基因结合并将其激活[3],例如,MyoD蛋白可以与鸡肌肉乙酰胆碱受体的一个亚基基因相结合从而启动这个基因[4];MyoD基因也可以自身激活,也就是其编码的MyoD蛋白可以结合至自身的上游DNA上而使其处于活化状态。MyoD基因对其它基因的作用可以是直接的,也可以是间接的。 * Leucine zipper proteins contain a hydrophobic leucine residue at every seventh position in a region that is often at the C-terminal part of the DNA-binding domain * 诱导物与阻遏蛋白迅速结合而改变其构象,使之迅速从O上解离,使RNApol与启动子形成开放型启动子复合物 * Cooperative binding of Lac Repressor results in the formation of a DNA Loop * 无trp时,所有转录该操纵元的RNApol都能通过弱化子 * 有trp时,一部分逃过阻遏蛋白监督的RNApol在弱化子处大部分被扣留,而只有10%能通过 * 下游有一个编码14aa的前导肽开放阅读框架,其中两个相连的trp的密码子UGG(60位) 对弱化作用的实现起重要作用 * λphage 的DNA进入寄主cell后,DNA上没有任何调节蛋白,因此寄主的RNApol便结合于PL和PR * 只表达一个小的区段,以原始菌体状态整合到寄主染色体上,即进行巧妙的调控 * 目前所知的大多是核酸结合蛋白或者是与核酸分子相互作用为其生理功能的蛋白质 * 当细胞内RF2供应充足时,核糖体到达第25个密码子后UGA时,RF2促成肽链合成的终止 * 当细胞内核糖体较多时,没有游离的rRNA存在,调控蛋白优先结合mRNA,此时调控蛋白控制的自身操纵元mRNA停止翻译 * 之所以称为魔斑,是因为AA饥饿时,E.coli的薄层层析图谱上有两种核苷酸与常见的核苷酸的迁移率不一样 * Euk.的酵母结合型、免疫球蛋白的分子多样性都是基因重排调控机制的体现 * Non-coding region (Junk?) Synchronizely--偶联 * Torsion--n.[物][机] 扭转, 转矩 * 脊椎动物基因常常伴随着CpG岛---------低甲基化的序列 * HMRa为使接合型由α转变为a所必须 接合型的改变,实际上是DNA序列的代换,依赖于序列同源性 匣子模型---cossette model * Pheromone---n. 〈生化〉信息素 * 处于激活态的基因,其起始转录受起始阶段控制,它是RNA聚合酶与启动子相互作用决定 一个转录因子的决定性指标是看它的功能,即发生转录所必需的蛋白质才是转录因子 (2)转录因子的分类 a、基本转录水平的转录因子(Trans-factor) 基础因子---Core promoter 上游因子---UPE 所有启动子表达所必须-------基础转录复合体 每个元件都有相 应的转录因子 元件名称 共有序列 结合DNA长度 因
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