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2016 ，36 (5)
植物研究 :747 ～ 752
Bulletin of Botanical Ｒesearch
基于高通量测序分析青藏高原特有植物
蓝 (Gentiana veitchiorum) SSＲ SNP
玉簪龙胆 的 和 特征
田尊哲1，2 高庆波1 陈世龙1 张发起1*
(1． ， ， 810001 ;2 ． ， 100039)
中国科学院高原生物适应与进化重点实验室 中国科学院西北高原生物研究所 西宁 中国科学院大学 北京
摘 要 利 Illumina HiSeqTM 2500 (Gentiana veitchiorum) ，
用 平台对青海省库泽县的蓝玉簪龙胆 进行高通量测序 共
得 SSＲ 8 588 ， SSＲ ; 54． 7% (4696 );
到 序列 条 对其 重复类型进行分析 三核苷酸重复类型所占的比例最大占 其次
是二核苷酸重复类型占41． 3% (3543); ，
四核苷酸重复类型 五核苷酸重复类型和六核苷酸重复类型所占的比例较
( 4% )。 AT /TA 9． 85% 9． 5% 。
少 共占 在二核苷酸重复类型中 重复类型所占的比例最大分别为 和 在微卫星中重
， 。
复单元的长度大小和重复次数成负相关 并且微卫星的总长度与重复单元的长度成正相关 在蓝玉簪龙胆的花
(GP-F) (GP-L) 253 789 249 417 SNP ， 51． 29% 51. 96% 。
和叶 中分别得到 和 个 位点 其中在非编码区上的比例为 和
分析发现蓝玉簪龙胆SNP 位点在编码区中同义转换所占的比例(48． 63% 和47． 96% )要远远高于非同义转换的
比例(0． 08% 和0． 08% )， 。
可能与功能基因序列相对稳定有关
关 ; ; ; ;
键词 蓝玉簪龙胆 高通量测序 微卫星 单核苷酸多态性 青藏高原
中图分类号:Q949． 776． 4
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