建立差异磷酸化蛋白质组学技术平台分析EB病毒瘤蛋白LMP1介导的信号转导通路-病理学与病理生理学肿瘤专业论文.docxVIP

建立差异磷酸化蛋白质组学技术平台分析EB病毒瘤蛋白LMP1介导的信号转导通路-病理学与病理生理学肿瘤专业论文.docx

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中文摘要摘要 中文摘要 摘要 EB病毒与多种肿瘤的发生发展密切相关,作为一个外界环境致 病因子,对其基因组功能分析发现其编码的潜伏膜蛋白1(1atent membralle口rotein 1,LMPl)是~个重要的瘤蛋白。在LMPl的羧基 末端存在三个功能性结构域CTARl、C1AR2和CTAR3,它们通过募 集信号衔接分子TRAFs、TR ADD和JAK3异常激活NF K B、AP.1 和SL盯三条信号转导通路。激活的转录因子Ⅻ7 K B、AP.1和Sn盯 进而调节下游靶基因EGFR、cyclm D1、MMP9、sun,ivin等的表达, 同时也通过某种机制调节一些下游蛋白的磷酸化。但是,受LMPl 调节的信号分子和下游功能效应蛋白质分子还远远没有得到阐明,并 且可能还存在未证实的由Lml介导的新的信号转导通路。 我们前期在鼻咽癌细胞中所研究的LMPl异常激活NFx B、AP—l、 JAK/sTAT信号转导通路,主要借鉴在B细胞中的研究模式。可是, 上皮来源的鼻咽癌细胞与B细胞存在组织类型差异,因此,EB病毒 编码的瘤蛋白LMPl与宿主细胞内基因的相互作用以及介导的信号转 导通路也就可能存在差异。 细胞内信号转导通路网络错综复杂,传统的信号转导通路研究策 略主要针对单条信号转导通路以及其中的单个信号转导分子,存在一 定的局限性。随着蛋白质组学研究方法引入信号转导通路研究中,产 生了一个新的研究领域一一信号转导蛋白质组学,简称为信号组学 (signalomics)。 基于信号转导分子大多数是低丰度蛋白质,用传统的蛋白质组学 研究策略时,高丰度蛋白质往往掩盖了低丰度蛋白质,使之很难分离 得到,但低丰度蛋白质又往往是功能效应蛋白质分子,具有重要的生 物学意义;并且在信号转导过程中大多数信号转导分子需要不同程度 的磷酸化(主要是丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸磷酸化)而将信号逐步传 递下去,因此从总蛋白质中单独分离出磷酸化蛋白质,显得极其重要。 博士学位论文 博士学位论文 中文摘要 为此,我们借助磷酸化蛋白质体内外富集策略,结合蛋白质组学 高通量技术,鉴定受LMPl调控的下游功能效应蛋白质分子(磷酸化 蛋白质分子);然后采用传统的信号转导通路研究策略建立髓病毒瘤 蛋白LMPl与下游功能效应蛋白质分子间的关系,初步构建雎病毒瘤 蛋白LMPl介导的信号转导通路网络。 我们拟采用磷酸酶抑制剂和磷酸基团金属亲和纯化(phosphate metal affinity chromatograph yJ PMAC)两种策略来富集磷酸化蛋 白质。我们研究证实采用磷酸酶抑制剂抑制细胞内磷酸酶活性可以有 效提高细胞内磷酸化蛋白质的总量,并且呈剂量和时间依赖性,从而 确定了丝/苏氨酸磷酸酶抑制剂和酪氨酸磷酸酶抑制剂的最佳工作浓 度和最佳处理时间。同时采用PMAc技术从细胞总蛋白质中分离纯化 出磷酸化蛋白质。我们以p—EGFR,p—p65和Q—tubulin分别作为磷 酸化蛋白质和非磷酸化蛋白质的代表,检测细胞总蛋白经过PMAC处 理后磷酸化蛋白质组分中是否存在非磷酸化蛋白质,和非磷酸化蛋白 质组分中是否存在磷酸化蛋白质,结果显示,磷酸化蛋白质组分中不 存在Q—tubulin,非磷酸化蛋白质中不存在p—EGFR和p—p65,说明 借助PMAC策略可以有效地分离磷酸化蛋白质与非磷酸化蛋白质。从 而建立了磷酸化蛋白质体内外富集技术平台。 在已经建立磷酸化蛋白质富集技术平台的基础上,我们确定了磷 酸化蛋白质富集结合蛋白质组学技术鉴定LMPl调节的磷酸化蛋白质 分子的可行性。我们用磷酸化蛋白质的总量计算、二维凝胶电泳以及 单个磷酸化蛋白质的western blot分析发现,CNEl和cNE卜LMPl细 胞经磷酸酶抑制剂处理后,抑制了LMPl介导的下游蛋白质磷酸化事 件,导致两细胞中磷酸化蛋白质的均一性。所以我们只好放弃磷酸酶 抑制剂这种磷酸化蛋白质富集策略,而只采用磷酸化蛋白质体外富集 策略:PMAC技术。 当细胞不经过磷酸酶抑制剂处理,而直接用PMAC技术从细胞总 蛋白中分离纯化出磷酸化蛋白质。磷酸化蛋白质总量计算显示,EB 病毒瘤蛋白LMPl可以增加细胞内磷酸化蛋白质总量的18.03%,差异 非常显著(卢O.00845)。通过分析富集的总磷酸化蛋白质中的单个磷 Il 博土学位论文 博土学位论文 中文摘要 酸化蛋白质的变化也发现,富集的磷酸化蛋白质中单个磷酸化蛋白质 p~EG

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