江豚核基因内元的遗传变异及鲸类RNASE1基因的适应性进化研究-生物学;遗传学专业论文.docxVIP

|llUllllltlltNlllT[1111IlllllllUlll |llUllllltlltNlllT[1111IlllllllUlllEIllnl Y1 922774 目录 摘要 ．I Abstract ．．II 前言 ．W 第一章中国水域鲸豚类的保护遗传学研究 1、 弓I言 1 l 白熏豚(Lipotes vexillifer) 1 2中华白海豚(Sousa chinensis) 3 3瓶鼻海豚(genus Tursiops) ．5 4江豚(Neophocaena phocaenoides) 6 5其他物种及其它方面的研究 ．7 结语 。9 参考文献 ．■ 。 10． 第二章 中国水域江豚核基因内元的遗传变异 18 弓f言 ．1 8 1材料和方法 20 1．1样品的采集 ．地o 1．2基因组DNA提取和目的片段的PCR扩增 2l 1-3数据分析 22 2结果 ．： 。23 2．1遗传多样性 。23 2．2系统地理学结构 25 2．3种群统计学分析 27 3讨论 。： ．．28 参考文献 ．．30 第三章鲸类RNASEl基因的适应性进化的初步分析 j5 引言 ．35’ 1材料和方法 36 1．1样品的采集 _36 1．2基因组DNA提取和PCR扩增 ．．36 1．3数据分析 b7 2结果 37． 3讨论 一： ．．39 3．1序列进化分析方法 39 3．2正选择位点的鉴定 40 参考文献 42 论文发表目录 ．．46 致谢 ．．47 摘要江豚核基因内元的遗传变异及鲸类 摘要 江豚核基因内元的遗传变异及鲸类 RNASEl基因的适应性进化研究 杨梅 南京师范大学生命科学学院遗传资源研究所 南京21 0046 摘要 本论文共包括三个部分： 1．综述近年来中国鲸豚类的保护遗传学研究进展 2．在之前线粒体，形态学测量及核微卫星工作的基础上，考虑到核基因内元资源丰、 富，所承受的进化压力小，可能存在更多的变异，所以我们通过分析144头江豚 (Neophocaenaphocaenoides)四个核基因内元的序列，进一步分析了中国水域江豚 的遗传多样性，种群遗传结构及其系统地理格局。中国水域的三个江豚种群：t南 海种群，黄海种群和长江种群总体的核苷酸多样性和单元型多样型分别为O．5％． 与O．98，0．6％与0．99，0．5％与O．95。同时总体的k值(PTH：0．29，P0．001； IFNl@：0．23，P0．001；RDS：0．12，P0．001；ⅪT：0．16，P0．001)表明超过70％的核 基因内元变异来自种群内。种群遗传结构分析表明，南海种群和长江种群的分化 程度最高，其次是南海种群与黄海种群，而黄海种群与长江种群的分化程度最低。 然而，并没有发现中国水域的江豚种群具有明显的系统地理格局。系统发生重建 和中介网络图(median-joining network)分析均未能把来自不同地理种群或者不 同水域的单元型区分为独立的进化枝。研究表明中国水域的三个江豚种群均具有’ 高的单元型多样性和相对较低的核苷酸多样性，种群间存在高水平的分化。此外， 还讨论了江豚，特别是长江江豚的保护管理对策。 3．测定了来自鲸目的5个物种及海豹，河马，除河马外这些物种都具有相对简单消化 系统，胃或盲肠中都缺少微生物消化。我们在鲸目动物及海豹的胰核糖核酸酶基、 因进化发现了正选择位点的存在。在无前肠发酵的动物中发现胰核糖核酸酶基因 的适应性进化为日后进一步研究该基因的功能和进化提供了参考。 关键词：江豚(Neophocaenaphocaenoides)，核内元(nuclear intron)，遗传分化， 保护；鲸目(cetacea)，RNASEl基因，适应性进化 AbstractSequence Abstract Sequence variability at four nuclear introns of the finless porpc andan adaptiveaaa ti ce evolutionevOIntlOn of digestivetligest e RN‘SE刚 A gene in cetaceans YangMei k Institute of Genetic Resources，College of Life Sciences，Nanjing Normal University, Nanjing 210046 Abstract 。111iS thesis includes three chapters： 1．Some advances in the studies of cetaceans in Chinese waters were reviewed． 2．Intraspecific genetic va