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摘要
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拮抗链霉菌Men—myco一93-63分类学鉴定 及其几丁质酶基因研究
摘要
形态特征、培养特征及生理生化特征分析发现,棉花黄萎病拮抗链霉菌 Men—myco-93-63孢子丝呈螺旋形,孢子椭圆形,孢予表面结构光滑。在九种不同 培养基生长良好,其基生菌丝及气生菌丝颜色分别为淡黄色和淡白色,在部分培养 基上培养可产生象牙黄或豆汁黄可溶性色素。链霉菌Men.myeo-93.63可在15。C~37
℃环境下生长,环境温度为45C时生长停滞。其存活pH值为pH5呻H12;明胶液
化;牛奶凝固;淀粉水解强,可利用纤维素;不产生H2S和黑色素,不还原硝酸盐: 利用葡萄糖、麦芽糖、甘油、木糖、果糖、蔗糖、肌醇、阿拉伯糖、鼠李糖,不利 用棉子糖、甘露醇、醋酸钠。
链霉菌Men-myeo一93—63与玫瑰黄链霉菌(Streptomyces roseoflavus)的形态特 征及培养特征一致。=者的16S rDNA序列相似性达到了99.93%。并且二者的16S rDNA序列中的120bp Y可变区序列完全相同。因此,根据链霉菌多相分类原则, 将链霉菌Men-myco一93—63定名为玫瑰黄链霉菌Men-myco-93—63(Streptomyces roseoflavus Men-myco一93-63)。
从GeneBank检索到39个克隆自链霉菌的几丁质酶基因,利用Clustalv程序 对其进行基因多序列排列,根据相似性大致分成3群,并根据B群和C群基因序 列的保守区域设计PCR引物,对河北农业大学植物病害生物防治研究室筛选并保 存的5株对棉花黄萎病菌具有抑制作用的链霉菌进行了分子探测,发现这5株链霉 菌普遍存在第19族几丁质酶基因和与Streptomyces lividans chiC相似的第18族几 r质酶基因。Streptomyces roseoflavusMen-myco-93—63的PCR扩增产物分别命名为 chi 19-I和chiC。序列分析表明,它们分别与StreptomycesgriseusHUT6037chiC(属 第19族几丁质酶)和Streptomyces lividans chiC(属第18族几丁质酶)的催化域序 列高度同源,前者为85.42%,后者为92.02%。
以大肠杆菌.链霉菌穿梭柯斯质粒pKC505为克隆载体,构建了玫瑰黄链霉菌
Men-myco一93—63在大肠杆菌LE392的基因文库。3168个转化子构成的文库覆盖率 达到了99.93%,插入外源DNA片段大小为20~30kb。利用chiC基因片段为探针, 从基因文库筛选到5个阳性克隆。表明所构建的基因文库比较完整,可以用于玫瑰
摘要黄链霉菌Men-myco-93—633抗生素生物合成基因的克隆。
摘要
黄链霉菌Men-myco-93—633抗生素生物合成基因的克隆。
利用染色体步移法测定了Streptomyces roseoflavus chiC基因1179bp片段序列, 该序列包含了典型的第18族几丁质酶基因的活性位点序列(Prosite数据库,编号: PS01095),并且包含了与蛋白质结构域数据库(Pfam)中第18族糖基水解酶(编 号:PF00704)基因相似的完整序列。表明该片段包含了Streptomyces roseoflavus chiC 的整个催化域序列,该序列编码354个氨基酸残基,与Streptomycescoelicolorch∞
催化域在核苷酸水平的的同源性为82.8%,在氨基酸水平的同源性为83.3%。
关键词:玫瑰黄链霉菌Men-myco-93—63;分类鉴定;几丁质酶基因;基因克隆
cosmid基因文库
Taxonomic
Taxonomic Identification ofa Biocontrol Agent Streptomyces sp.Men—myco-93—63 against Verticillium dahliae and Characterization of Its Chitinase Genes
Abstract
LrU Zhanliang
Streptomyces sp.Men-myco-93—63,with screwy aerial hyphae and oval spore, grows well irl nine different media and produces ivory,yell
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