金华猪经济性状选择信号探测-动物遗传育种与繁殖专业论文.docxVIP

金华猪经济性状选择信号探测⑧ 金华猪经济性状选择信号探测 ⑧ 论文作者签名： 指导教师签名： 论文评阅人1： 评阅人2： 评阅人3： 评阅人4： 评阅人5： 答辩委员会主席： 渣玉查 委员1： 筮主垫 委员2： 韭金撞 委员3： 医塞国 委员4： 王垒迸 委员5： 万方数据 Detect Detect i on of s e l ect i on S i gnatures of t ra i t s of IntereS t 1n J 1nhua P19S 一i Auth。r，s signatu re． Li圣呦豳Q ／?z叼@ Supervisor’S signature： Wang ZhengUang ExternaI Reviewers： Examining Committee Chairperson Examining Committee Members： Date of oral defence： 』垡旦金。至Q至鱼 万方数据 本论文由浙江省(畜禽)新品种重大科技专项 本论文由浙江省(畜禽)新品种重大科技 专项 项目编号：201 2C1 2906—1 Su pported by the progra m of breedi ng of new species of agricu ltu ra l (1ivestock and poultry)in Zhejiang Provi nce Itern No．201 2C1 2906-1 万方数据 浙江大学研究生学位论文独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的 浙江大学研究生学位论文独创性声明 本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的 研究成果。除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发 表或撰写过的研究成果，也不包含为获得逝姿盘鲎或其他教育机构的学位或 证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文 中作了明确的说明并表示谢意。 一签名如坼 ．2016椭蕊日 学位论文版权使用授权书 本学位论文作者完全了解逝婆盘堂有权保留并向国家有关部门或机 构送交本论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权浙江大堂 可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索和传播，可以采用影 印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。 (保密的学位论文在解密后适用本授权书) 勺 一繇老秒挥心胳名：门勃 签字日期： 2016年6月酗 签字日期： 2016年6月嘲 万方数据 金华猪经济性状选择信号探测 金华猪经济性状选择信号探测 浙江大学硕士论文 匿录 英文缩略表 8 摘要 。9 Abstract： ．． ． ． ． ．． ．． 10 第一章文献综述 王2 1．猪种介绍 ．．12 1．1金华猪 ．．12 1．2碧湖猪 ．．13 1．3嵊县花猪 ．．13 1．4嘉兴黑猪 ．．14 1．5淳安花猪 ．．15 1．6兰溪花猪 ．．16 1．7岔路黑猪 一18 2．选择信号的概念： 一18 3．检测选择信号的方法： ．．18 3．1高比例的转变功能突变： 19 3．2遗传多样性的衰减： ．．19 3．3衍生的等位基因： ．．20 3．4群体间分化： ．．20 3．5长单倍型： ．．． 21 4选择信号在畜禽育种中的研究进展： ．21 5 GGRS远源杂交群体SNP分型方法： 22 5．1方法概述 22 5．2全基因组标记的探测和分型 ．．24 6．种间单倍型纯合性检验Cross Population Extended Haplotype： 25 7．基因语义学(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)： 26 7．1基因语义学(GO)： ．26 7．2京都基因与基因组百科全书(KEGG) 27 8本研究的目的和意义： ．27 第二章试验材料和方法： 29 1．试验材料： ．．29 1．1实验试剂： ．．29 1．2实验仪器： 29 1．3实验所需网站链接： ．．30 6 万方数据 金华猪经济性状选择信号探测 金华猪经济性状选择信号探测 浙江大学硕士论文 2．实验方法： ．．30 2．1试验样品采集及样本处理： 30 2．2系统进化树的构建： 31 2．3种间单倍型纯合性检测(xP．EHH)： 31 2．4与发生正向选择的区域重合的基因和QTL的检测： ．31 2．5 GO和KEGG路径基因富集分析： 32 第三章试验结果： 33 1系统进化树： ．．33 2种间单倍型纯合性检测(XP—EHH)： 34 3与发生正向选择的区域重合的基因和QTL： 一36 4 G