药物发现的虚拟筛选方法(1).pptVIP

药物发现的虚拟筛选方法 第一节 概述 计算机模拟与化学合成、生物测试的结合构成了后基因组时代新药研究的新策略。从已有的化合物，包括合成化合物和天然产物中寻找药物或先导化合物，是药物发现的一个重要途径。到目前为止，人们只是针对大约500 种疾病的治疗靶点，筛选了现已发现的2 000 多万种有机化合物中大约10%的化合物，但仍然有大量的潜在活性化合物未被发现。 随着科学技术的发展，各种先进技术应运而生（X 射线晶体衍射法、多维核磁共振法、扫描隧道显微技术等），使得越来越多生物靶标（蛋白质、核酸、多糖等）的空间结构被解析。 同时计算机科学的发展又极大地提高了计算和分析的速度和精度。 因此，自上世纪90 年代起，合理药物设计就逐渐成为一种实用技术接融入到药物研发的各个环节。 一、合理药物设计 成功例子 奈非那韦（nelfinavir） 抗艾滋病药物 HIV-1蛋白酶抑制剂 依马替尼（imatinib） 治疗慢性骨髓型白血病药物 二、数据库空间 化学信息学和生物信息学的共同点 研究对象 化学信息学：小分子 生物信息学：小分子结构单元构成的基因和蛋白质等大分子，本质上都是 化学物质。 计算方法 基于回归的聚类分析；支持向量机；神经网络；遗传算法等。 发挥作用方面 核酸和蛋白质功能和结构；小分