课件：兽医流行病学 刘文博 第十三章 分子流行病学.ppt

* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 实施严格的生物安全措施和在流行地区使用疫苗是控制该病主要的方法。因此，弄清我国大陆H9N2亚型AIV流行株之间的关系以及该亚型病毒在疫苗免疫选择压力下的遗传变异情况对有效控制和消灭本病的流行具有重要意义。 研究内容 对从我国12个省1996年-2001年间分离到的25株H9N2亚型AIV流行株的HA基因全序列进行分析和比较，以阐明这些毒株之间的关系 本研究的25株H9N2亚型AIV为我国大陆1996年-2001年期 间的流行株，分别分离自我国： 研究方法 1. 根据已发表的H9亚型AIV的HA基因序列，借助于Prime Primer5.0软 件设计一对预期扩增HA基因编码区全序列的特异性引物，引物序列为： P1:5’CCCAAGCTTATGGAAACATATTCACTA-3’ P2:5’-CCTGTCGACGTAGAAACAAGGGTGTT-3’ 2.通过RT-PCR方法扩增出目的片段； 3. 将扩增所得的片段测序，获得了25个HA基因的编码区全序列； 4.从已发表的资料中搜索得到以下序列： （1）10株病毒HA基因编码区全序列； （2）32株病毒HA基因55-1152碱基区1098个核苷酸序列； （3）73株病毒HA基因613-992碱基区380个核苷酸序列； 5. 基于本研究测得的25个HA基因序列和搜索得到的以上序列，借助DNAStar软件包中Megalign软件进行以下几个方面的比较： （1）比较35个毒株HA基因编码区全序列的同源性； （2）比较57个毒株HA基因HA1上几个重要的氨基酸位点； （3）分别以35个毒株HA基因编码区全序列、57个毒株HA基因55-1152碱基区1098个核苷酸序列和98个毒株HA基因613-992碱基区380个核苷酸序列建立遗传发生树，进行遗传发生关系研究。 6.通过以上几个方面的比较，分析中国大陆毒株之间的关系以及它们与世界其它国家毒株的关系。 结 果 35株个HA基因1-1680碱基区（1680nt）的遗传发生树 I II IIIb III IIIa1 IIIa2 IIIa 57个HA基因55-1152碱基区（1098nt）遗传发生树 III II I IIIb2 IIIa IIIa1 IIIa2 IIIb IIIb1 IIIb1 98个HA基因612-993碱基区（380nt）遗传发生树 I Ia Ib II III IIIa IIIa IIIb IIIa1 IIIa2 IIIb1 IIIb2 98个HA基因613-992碱基区（380nt） 遗传发生树 缩略图 I II Ia Ib III IIIa IIIa1 IIIa2 IIIb IIIb1 IIIb2 HK 结 论 通过以上的研究可以得出如下结论： 1. 已报道的我国大陆鸡群中1994-2001年期间流 行的H9N2亚型禽流感病毒为同一来源，已形 成了一个稳定的亚系，明显不同于与香港人 H9N2病毒感染有关的病毒； 2. 鸟类的国际贸易在H9亚型禽流感的流行病学 上具有重要意义。 后面内容直接删除就行 资料可以编辑修改使用 资料可以编辑修改使用 资料仅供参考，实际情况实际分析 主要经营：课件设计，文档制作，网络软件设计、图文设计制作、发布广告等 秉着以优质的服务对待每一位客户，做到让客户满意！ 致力于数据挖掘，合同简历、论文写作、PPT设计、计划书、策划案、学习课件、各类模板等方方面面，打造全网一站式需求 * * * * * * * * * * * * * * * * * * Multiplex PCR analysis for exon deletions in the DMD gene Two lanes with results typical for deletions 第三节 分子流行病学的研究方法 分子流行病学是将分子生物学的理论和方法应用于流行病学调查研究，其研究方法是分子生物学和流行病学方法的结合。 分子生物学研究方法 核酸电泳图谱分析（质粒图谱和RNA电泳图谱） 核酸酶切图谱分析 寡核苷酸指纹图谱分析 基因探针和核酸杂交 聚合酶链反应（PCR） 核苷酸序列分析 多位点酶电泳 DNA芯片 核酸电泳图谱分析（质粒图谱和RNA电泳图谱） 核酸酶切图谱分析 寡核苷酸指纹图谱分析 基因探针和核酸杂交 实例：NDV和H9亚型AIV的分子流行病学 新城疫部分 90年代以前全球范围内三次大流行，并被认为正在发生ND 第四次大流行我国