基于丝苏氨酸位点-修饰网络的蛋白质翻译后修饰预测研究-生物医学工程专业论文.docxVIP

万方数据 万方数据 摘要摘要 摘要 摘要 蛋白质翻译后修饰在蛋白质一蛋白质相互作用与细胞过程等多种生物学行为 中起重要调节作用，此外，翻译后修饰与许多疾病如癌症、糖尿病等相关，因此 翻译后修饰位点预测对于了解生命过程与疾病的预防治疗等有重大意义。 丝氨酸和苏氨酸上的翻译后修饰类型主要包括磷酸化、0．糖基化与乙酰化。 实验技术的不断发展，积累了大量的翻译后修饰位点数据。由于实验方法成本高， 且受环境条件限制，因此促进了计算方法的不断发展。目前已有的计算方法大部 分通过蛋白质的局部序列信息进行模型训练，且只能对一种翻译后修饰进行预测。 现研究表明砌situ PTM可以反映不同翻译后修饰间潜在功能联系，因此如将其 应用于翻译后修饰预测研究，可有效提升翻译后修饰位点预测能力。本文提出了 表征加situ PTM信息的位点一修饰网络(site．modification network，SMNet)，之后 利用SMNet网络特征进行丝氨酸和苏氨酸上翻译后修饰位点预测。具体研究内 容如下： 首先，本文从多种翻译后修饰数据库中收集人类翻译后修饰数据，从中提取 in situ PTM信息，并利用该信息构建SMNet网络。之后将SMNet网络特征与蛋 白质序列特征整合成特征集，并利用支持向量机(Support Vector Mechine，SVM) 进行翻译后修饰位点预测，该过程被称为SMNet