番茄AT ̄hook基因家族的鉴定及胁迫条件下的-植物遗传资源学报.PDF

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植物遗传资源学报2016ꎬ17(2):303 ̄315 Journal of Plant Genetic Resources DOI:10.13430/ j.cnki.jpgr.2016.02.016 番茄AT ̄hook基因家族的鉴定及胁迫 条件下的表达分析 1ꎬ2ꎬ3 2ꎬ3 2 2ꎬ3 2 2 1 1 2 丁丽雪 ꎬ李  涛 ꎬ李植良 ꎬ徐小万 ꎬ李  颖 ꎬ王恒明 ꎬ王永飞 ꎬ马三梅 ꎬ黎振兴 1 2 ( 暨南大学生命科学技术学院ꎬ广州510532ꎻ 广东省农业科学院蔬菜研究所ꎬ广州510640ꎻ 3广东省蔬菜新技术研究重点实验室ꎬ广州510640)     摘要:AT ̄hook蛋白家族在植物生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用ꎮ 本研究在番茄基因组 范围内ꎬ利用生物信息学方法对番茄AT ̄hook基因家族的成员、分布、结构和功能进行分析ꎮ 结果表明ꎬ番茄AT ̄hook 家族包 含32 个成员ꎬ分为3种类型ꎬ其中类型Ⅰ含有13 个成员ꎻ遗传进化分析表明番茄AT ̄hook基因成员与拟南芥家族基因具有相 似分类ꎮ 利用实时荧光定量PCR对番茄32 个基因开展组织表达分析ꎬ结果表明AT ̄hook基因具有表达差异ꎬ主要在根和花 中表达较高ꎮ 氧化胁迫分析结果表明ꎬ32 个基因受ABA、SA、盐、高温和低温诱导表达ꎬ其中部分基因显著上调或下调表达ꎬ很 可能参与了番茄逆境胁迫条件下的防御应答反应ꎮ 本研究结果将为番茄AT ̄hook 家族基因的深入研究提供依据ꎬ为进一步解 析番茄AT ̄hook基因的功能奠定基础ꎮ     关键词:番茄ꎻAT ̄HOOK基因家族ꎻ生物信息学ꎻ基因表达ꎻ氧化胁迫 Genome ̄wide Identification and Expression Analysis in Oxidative Stress of AT ̄hook Gene Family in Tomato 1ꎬ2ꎬ3 2ꎬ3 2 2ꎬ3 DING Li ̄xue ꎬLI Tao ꎬLI Zhi ̄liang ꎬXU Xiao ̄wan ꎬ 2 2 1 1 2 LI Ying ꎬWANG Heng ̄ming ꎬWANG Yong ̄fei ꎬMA San ̄mei ꎬLI Zhen ̄xing 1 ( Department of BiotechnologyꎬJinan UniversityꎬGuangzhou510632ꎻ 2Vegetable Research InstituteꎬGuangdongAcademy of Agricultural SciencesꎬGuangzhou510640ꎻ 3 Guangdong Key Laboratoryfor New Technology Research of VegetablesꎬGuangzhou510640) Abstract:AT ̄hook proteins played an important role in regulation of eukaryotic gene expressionꎬand implica ̄ ted in plant develop

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