瘤胃壁黏附细菌的多样性及其影响因素-动物营养学报.PDF

动物营养学报２０１４，２６（２）：３０４３１０ ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＡｎｉｍａｌＮｕｔｒｉｔｉｏｎ 　 ｄｏｉ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００６２６７ｘ．２０１４．０２．００３ 瘤胃壁黏附细菌的多样性及其影响因素 １，２ １，３，４ １，４ １，３，４ 代文婷 　郑　楠 　赵圣国 　王加启 （１．中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，农业部奶产品质量安全风险评估实验室，北京 １００１９３；２．吉林大学 动物科技学院，长春 １３００６２；３．农业部奶及奶制品质量监督检验测试中心，北京 １００１９３；４．中国农业科学院 北京畜牧兽医研究所，动物营养学国家重点实验室，北京 １００１９３） 摘　要：受纯培养方法的限制，瘤胃壁黏附细菌群体结构和功能的研究发现相对较少，但近几 年随着分子生物学和生物信息学的快速发展，尤其是 １６ＳｒＤＮＡ文库和聚合酶链反应 －变性梯 度凝胶电泳结合（ＰＣＲＤＧＧＥ）的应用，瘤胃壁黏附细菌的多样性研究越来越多。本文将从瘤胃 壁黏附细菌的多样性、影响因素和功能３个方面对其研究进展进行综述。 关键词：瘤胃壁黏附细菌；多样性；影响因素；功能 中图分类号：Ｓ８１１．６；Ｓ８２３　　　　文献标识码：Ａ　　　　文章编号：１００６２６７Ｘ（２０１４）０２０３０４０７ 　　反刍动物瘤胃细菌的数量和种类最多，根据 １　瘤胃壁黏附细菌多样性 细菌的定植部位可分为３类：瘤胃液相细菌、瘤胃 １．１　基于纯培养方法分离的瘤胃壁黏附细菌 固相细菌和瘤胃壁黏附细菌。２０世纪，研究人员 　　２０世纪，研究人员主要通过纯培养法研究瘤 主要借助显微镜检和分离培养法对瘤胃壁黏附细 胃壁黏附细菌，所分离出的菌株见表１。瘤胃壁黏 菌进行研究，分离出了一些尿素分解菌、蛋白降解 附细菌多为杆菌、球菌等。纯培养发现瘤胃壁黏 菌及纤维素分解菌等，同时还发现瘤胃壁黏附细 附菌群在瘤胃里的比例较低，占总菌数的１％ ～ ［１］ ［１］ ［２］ ［４］ 菌在氧自由基的清除 、尿素降解 、组织循环 ２％ 。 ［３］ ［５］ 及上皮屏障 等方面起到重要作用。由于瘤胃中 　　１９９０年，Ｓｅｍｊéｎ等 从瘤胃壁分离出１株很 大于９０％的细菌无法分离培养，因此，纯培养方法 常见的尿素降解菌，为革兰氏阳性球菌，占瘤胃壁 限制了对瘤胃壁细菌的研究，尤其是细菌群落的 黏附菌群总数的１１．７％～１４．１％，推测它可能是 多样性和功能。近些年来，分子生物学方法，如变 葡萄球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）或微球菌（Ｍｉｃｒｏｃｏｃ 性梯度凝胶电泳（ｄｅｎａｔｕｒｉｎｇｇｒａｄｉｅｎｔｇｅｌｅｌｅｃｔｒｏ ［５］ ｃｕｓ）。同年Ｓｅｍｊéｎ等 从公牛瘤胃壁中分离出２ ｐｈｏｒｅｓｉｓ，ＤＧＧＥ）、限制片段长度多态性（ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎ 株牛链球菌（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）和 １株大肠杆菌（Ｅ． ｆｒａｇｍｅｎｔｌｅｎｇｔｈｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ，ＲＦＬＰ）、１６ＳｒＤＮＡ ［６］ ｃｏｌｉ）。Ｓｔｙｒｉａｋ等 从犊牛瘤胃壁上分离出６株乳 文库和高通量测序等被广泛地应用在瘤胃微生物 酸菌（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）和４株牛链球菌。 研究中，丰富了对瘤胃微生物的种类和多样性等 　　纯培养发现瘤胃黏附细菌与瘤胃内容物细菌 方面的认识，也推动了对瘤胃壁黏附细菌的深入