基于线粒体COI序列的中国沿海鲀形目鱼类DNA条形码研究-生物学微生物学专业论文.docxVIP

万方数据 万方数据 基于线粒体 COI 序列的中国沿海鲀形目鱼类 DNA 条形码研究 中文摘要 鲀形目（Tetraodontiformes）现存 10 科 100 属约 350 种, 主要分布在热带和亚热带海 洋，仅少数种类定居在淡水中，或在一定季节进入江河。鲀形目很多种类是重要的养殖鱼 类和海洋捕捞对象，其中绿鳍马面鲀（Thamnaconus modestus）、黄鳍马面鲀（T.hypargyreus） 等目前面临资源枯竭的困境。东方鲀属（Takifugu）鱼类近年来在水产养殖、河豚毒素医药 开发、脊椎动物基因组研究方面有着广泛的应用，具有重要的经济地位、科研及医药价值， 与此同时误食河鲀引起的中毒乃至死亡事件也时有发生。准确的物种鉴定不仅能有效地区 分鲀毒鱼类，而且可以促进渔业资源合理开发、生态调查及生物多样性保护。但由于鲀形 目鱼类外部形态总体差异较大，近缘种间十分相似，传统分类学多以条纹、斑点、体色等 易受主观因素影响的形态特征作为主要辨别依据，以致至今鲀形目鱼类分类一直存在争 议。DNA 条形码通过对标准基因 DNA 序列的分析快速鉴定物种，已成功应用于动物、植 物及微生物。本文测定了中国沿海 8 科 19 属 33 种 110 尾鲀形目鱼类线粒体 COI 基因 5’ 端 652 bp 的序列，结合 GenBank 下载的序列，共分析了 8 科 25 属 56 种 210 条鱼类 COI 序列，旨在利用 DNA 条形码技术鉴定我国沿海常见的鲀形目鱼类，澄清目前分类的混乱， 揭示可能存在的隐存种，并进行初步的系统发育分析，基于 K2P 替代模型的研究结果如下： （1）鲀形目亚目内科间、科内属间、属内种间、种内平均遗传距离分别为 20.38% （18.59%-27.04%）、16.57%（0.89%-22.74%）、7.35%（0.03%-17.09%）、0.56%（0-5.41%）， 其中 53 种种内遗传距离小于 2%的遗传距离阈值，48 种种内遗传距离小于 1%。56 种鱼类 种间平均遗传距离约为种内遗传距离的 34 倍，51 种鱼类最小种间遗传距离大于最大种内 遗传距离，在种内、种间乃至属间均无重叠，形成理想的 DNA 条形码间隙。但东方鲀属 的鱼类可能受到种间杂交、近期辐射进化等干扰，墨绿东方鲀（T.basilevskianus）与红鳍 东方鲀（T.rubripes）、双斑东方鲀（T.bimaculatus）与黄鳍东方鲀（T.xanthopterus）等未 形成明显的 DNA 条形码间隙；而兔头鲀属（Lagocephalus）鱼类种间遗传距离已经达到鲀 形目鱼类属间平均水平（16.57%），分类地位需要进一步研究。 （2）在邻接树上鲀形目鱼类总体按物种名聚类，与形态学鉴定结果基本一致；属内 能 形 成具 有较 高支 持率 的 分支 ，但 较高 阶类 群 的系 统发 育关 系不 明 确。 除 兔头鲀属 （ Lagocephalus ） 外 ，其余 24 个属均 为 单系。 马面鲀属 （ Thamnaconus ） 的 马面鲀 I （T.septentrionalis）与黄鳍马面鲀（T.hypargyreus）、东方鲀属（Takifugu）的铅点东方鲀 （ T.alboplumbeus ） 和 斑点东方鲀（ T.poecilonotus ） 可 能 存 在 同 物 异 名 现 象 。 棘箱鲀 （Kentrocapros aculeatus）、尖鼻箱鲀（Rhynchostracion nasus）、翻车鲀（Mola mola）等可 能存在隐存种。 关键词：鲀形目、东方鲀属、DNA 条形码、细胞色素氧化酶 I 基因 II DNA barcoding of Tetraodontiformes in coastal waters of China Abstract The order Tetraodontiformes comprises approximately 350 species overall and are divided into 100 genera, 10 families, 6 superfamilies. Most dwell in tropical and subtropical Pacific, Indian and Atlantic Ocean, but a few species live in freshwater or enter into rivers in some season. Many species are economically-important subjects of aquaculture and marine fisheries, of which Tham