氨基酸蛋白质和核酸.pptVIP

第一节 氨基酸 氨基酸可以根据氨基和羧基的相对位置分为α-氨基酸、β-氨基酸、γ-氨基酸等。从天然蛋白质水解得到的氨基酸有30余种，比较常见的有20种左右，这些氨基酸(除脯氨酸外)均为α-氨基酸。 3 . 命名 氨基酸可按系统命名法命名，但为了方便，一般都用俗名 。此外每个氨基酸还都有一个英文缩写符号。例如： 二、α-氨基酸的物理性质 α-氨基酸大都为无色晶体，熔点一般在200～300℃之间，比相应的羧酸或胺类高。多数氨基酸能溶于水，而难溶于有机溶剂。 某些氨基酸具有鲜味，例如食用味精就是谷氨酸钠盐，但也有不少氨基酸无味或具有苦味。  除甘氨酸外，α-氨基酸都有旋光性。 思考题： 如果把甘氨酸、谷氨酸和赖氨酸三种氨基酸混合起来，溶液pH调至5.97，①这些氨基酸各带什么电荷？②在电场中移动方向？ pH=5.97 在电场中 甘氨酸 偶极离子 不移动 谷氨酸 负离子 向正极移动 赖氨酸 正离子 向负极移动 用这种方法可分离不同的氨基酸，这种方法叫电泳。 在等电点时氨基酸的溶解度最小，易生成沉淀。也可用分级沉淀的方法分离氨基酸混合物。 第四节 核酸 一、核酸的组成 3．核苷 核苷是由戊糖的苷羟基，与嘌呤碱9位或嘧啶碱1位氮上的氢原子脱水缩合，形成的含氮糖苷。 核酸中的糖苷键均为β-糖苷键。 *3. 结构 肽键中的p?π使C—N具有部分双键的性质，其键长介于单键键长C—N (0.149nm)和双键键长(0.127nm)之间，约0.132nm。 C N O O C N X射线衍射法测定表明，组成肽键的六个原子共平面。羰基碳原子的三个键之间的夹角和氨基氮三个键之间的夹角都接近120°。由于共轭效应，肽键中的C—N键不能自由旋转，所以存在顺反两种可能的构型： 顺式构型 反式构型 在蛋白质中以反式构型存在，反式构型在能量较稳定。 C N O C H C C N O C H C 肽的几何形状 *二、多肽结构的测定 1. 多肽组成的测定 一定质量的多肽试样 → 酸水解 → 离子交换柱色谱法分离 → 水合茚三酮显色 → 定性，定量 → 根据多肽相对分子质量和所含氨基酸的种类，确定各种氨基酸分子的数目——全自动氨基酸分析仪的测定原理。 2. 氨基酸顺序的测定 多肽链中氨基酸的排列顺序（N-端 → C-端）称为氨基酸顺序，是多肽和蛋白质最重要的特性之一。 特定的酶→肽链部分水解→较小的片段→端基分析法测定每个小片段中氨基酸的排列顺序→逐步确定整个多肽链中氨基酸的排列顺序。 在N-端引入具有特定基团的标记化合物，这种标记基团有颜色、荧光、紫外吸收等性质，然后分离鉴定具有这种基团的氨基酸衍生物。 重点讨论N-端氨基酸单元的分析 (1)Sanger(桑格尔)法 2,4-二硝基氟苯(DNFB) 肽的DNP衍生物 DNP-N-端氨基酸(黄色) R O2 N NO2 HNCHCONHCHCO R H2O/H + O2N NO2 HNCHCOOH R R + H2 NCHCOOH + ...... R R F NO2 O2 N R + H2 N CHCONHCHCO R 2,4-二硝基氟苯与多肽链中的N-端氨基酸反应，在N-端生成DNP衍生物，然后在酸中水解，肽键断类，但DNP键保留，仍留在N-端氨基酸上。DNP-N-端氨基酸为黄色，很容易和其它氨基酸分离和鉴定。 （2）Edman（艾德曼）法 异硫氰酸苯酯(PTC） PTC衍生物 R + H HN CHC NHCHC R O O C6 H5 N C S OH - O O R NHCHC NHCHC R C6 H5 NHC S O O R NHCHC NHCHC R C6 H5 NHC S 苯基乙内酰硫脲衍生物 肽链其余部分 此法的优点是只水解带标记的氨基酸，其余部分完整地保留下来。 HCl N N H C6 H5 S O R + H2 NCHCO R 产物经分离后，缩短后的肽链可以继续进行第二个、第三个……N-端氨基酸的