裸燕麦ssr标记连锁群图谱的构建及β-葡聚糖含量qtl的-中国农业科学.pdfVIP

中国农业科学 2014,47(6): 1208-1215 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.06.017 裸燕麦SSR标记连锁群图谱的构建及β-葡聚糖含量QTL 的定位 吴 斌，张 茜，宋高原，陈 新，张宗文 （中国农业科学院作物科学研究所，北京 100081） 摘要：【目的】构建裸燕麦分子遗传图谱，发掘燕麦β-葡聚糖基因紧密连锁的分子标记，为高β-葡聚糖含 量燕麦种质资源的利用及裸燕麦分子标记辅助育种提供理论和实践依据。【方法】以高β-葡聚糖地方品种夏莜麦 为父本，育成品种赤38 莜麦为母本构建的包含215 个F 家系为图谱构建群体，利用SSR 分子标记进行遗传分析， 2:3 构建分子遗传图谱。通过美国谷类化学会（AACC ）发表的标准葡聚糖含量测定方法（AACC Method 32-23 ）测定各 家系的β-葡聚糖含量，利用复合区间作图法进行燕麦β-葡聚糖含量性状进行遗传定位与分析。【结果】利用筛选 出的231 对SSR 引物在F 后代群体上进行检测，共得到261 个多态性标记位点，利用JoinMap 4.0 软件对上述获 2 得多态性分子标记进行遗传连锁分析，在LOD ≥5.0 情况下，构建遗传图谱，得到包含 26 个连锁群、182 个标记 位点的遗传图谱，覆盖基因组 1 869.7 cM，标记间平均距离为10.6 cM，每个连锁群上的标记数在2—14 个之间， 连锁群长度在10.6—235.1 cM。对亲本及后代群体β-葡聚糖含量的测定结果表明，β-葡聚糖含量在后代群体中 表现出明显的分离，且呈现为连续变异，变异系数为 18.72%，说明β-葡聚糖含量性状是受多基因控制的数量性 状，群体符合QTL 定位的要求。利用QTL 分析软件WinQTLCart 2.5 对 SSR 数据进行分析，采用复合区间作图法 （composite interval mapping，CIM ）对全基因组进行QTL 扫描，以LOD 值5 作为阈值对β-葡聚糖含量可能存 在的QTL 进行定位和效应估计，检测到4 个与β-葡聚糖含量相关的QTL 位点，其中qBG-1 位于连锁群LG20 上， 与最近的标记AM591 的距离10.0 cM。加性效应值为0.21，可以解释的表型变异为10.9%；qBG-2 和qBG-3位于连 锁群LG23 上，其中qBG-2 与最近的标记AM1823 的距离4.6 cM，qBG-3 与最近的标记AM641 的距离1.9 cM，加性 效应值分别为-0.23 和-0.22，可以解释的表型变异分别为3.2%和2.7%；qBG -4 位于连锁群LG25 上，与最近的标 记AM302 的距离6.8 cM，加性效应为0.84，可以解释的表型变异为27.6%，其中存在的2 个主效QTL qBG-1 和qBG -4,都来自于高β-葡聚糖含量的父本夏莜麦。【结论】构建了大粒裸燕麦SSR 分子标记连锁群图谱，并定位了4 个 控制β-葡聚糖含量的QTL 位点。 关键词：裸燕麦；连锁群图谱；SSR；β-葡聚糖；数量性状 Construction of SSR Genetic Linkage Map and Analysis of QTLs Related to β-glucan Content of Naked Oat (Avena nuda L.) WU Bin, ZHANG Qian, SONG Gao-yuan, CHEN Xin, ZHANG Zong-wen （Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081 ） Abstract : 【Objective 】A molecular genetic linkage ma