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江苏农业学报(JiangsuJ.of Agr.Sci.),2016,32(2):399~407
http:/ / www.jsnyxb.com 399
朱 鹏,陈集成,陈 凤,等. 水牛Sohlh2基因的克隆分析及其表达[J].江苏农业学报,2016,32(2):399⁃407.
doi:10.3969/ j.issn.1000⁃4440.2016.02.025
水牛Sohlh2 基因的克隆分析及其表达
1,2 1 1 1,3 1 1 1 1
朱 鹏 , 陈集成 , 陈 凤 , 苏 节 , 李海洋 , 韦英明 , 杨素芳 , 石德顺
(1.广西大学亚热带生物资源保护利用国家重点实验室,广西 南宁 530004; 2.中国农业科学院广西水牛研究所,广西 南宁
530001; 3.广西医科大学医学科学实验中心,广西 南宁 530001)
摘要: 为阐明广西沼泽型水牛Sohlh2基因在水牛不同组织中的表达规律,根据GenBank 已公布的牛Sohlh2
基因序列,设计其编码区(CDS)扩增引物,应用RT⁃PCR方法扩增克隆获得目的基因片段;应用生物信息学方法,系
统分析了水牛Sohlh2 的遗传进化以及蛋白质的理化性质、二级和三级结构;并应用RT⁃QPCR技术对Sohlh2基因在
水牛组织(器官)的表达进行了分析。 结果表明:水牛Sohlh2基因编码区全长 1281bp,共编码426个氨基酸。 多
重序列比较分析结果显示水牛Sohlh2 核苷酸序列与牛、绵羊、山羊、猪、马、人和小鼠相应序列的相似性分别为
98%、96%、96%、85%、86%、81%和72%,系统进化树显示Sohlh2基因在不同物种以及进化的过程中具有高度保守
性。 Sohlh2蛋白质呈弱碱性,无信号肽,在细胞中亚定位于细胞核中,存在bHLH结构。 水牛Sohlh2基因在水牛垂
体、大脑、肝脏、骨骼、卵巢和睾丸等11个组织(器官)细胞中具有不同程度的表达,其中睾丸细胞中表达量最高,垂
体和生殖脊细胞中表达量次之,卵丘细胞中表达量低,心脏、肺脏、肌肉细胞和颗粒细胞中不表达。
关键词: 水牛; Sohlh2基因; 克隆分析; 表达
+
中图分类号: S823.8 3 文献标识码: A 文章编号: 1000⁃4440(2016)02⁃0399⁃09
Cloning and expression pattern of buffalo Sohlh2 gene
1,2 1 1 1,3 1 1
ZHU Peng , CHEN Ji⁃cheng , CHEN Feng , SU Jie , LI Hai⁃yang , WEI Ying⁃ming ,
1 1
YANG Su⁃fang , SHI De⁃shun
(1.StateKey Laboratoryfor Conservationand Utilizationof SubtropicalAgro⁃bioresources,Guangxi University,Nanning530005,China; 2.GuangxiBuffa⁃
lo ResearchInstitute,ChineseAcademy of AgriculturalScience,Nanning 530001,China; 3.MedicalScientificResearch Centre,GuangxiMedical Universi⁃
ty,Nanning 530001,China)
Abstract: To identify the expression pattern of
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