水牛Sohlh2基因的克隆分析探究及其表达.pdfVIP

水牛Sohlh2基因的克隆分析探究及其表达.pdf

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江苏农业学报(JiangsuJ.of Agr.Sci.),2016,32(2):399~407 http:/ / www.jsnyxb.com 399 朱  鹏,陈集成,陈  凤,等. 水牛Sohlh2基因的克隆分析及其表达[J].江苏农业学报,2016,32(2):399⁃407. doi:10.3969/ j.issn.1000⁃4440.2016.02.025 水牛Sohlh2 基因的克隆分析及其表达 1,2 1 1 1,3 1 1 1 1 朱  鹏 ,  陈集成 ,  陈  凤 ,  苏  节 ,  李海洋 ,  韦英明 ,  杨素芳 ,  石德顺 (1.广西大学亚热带生物资源保护利用国家重点实验室,广西 南宁 530004; 2.中国农业科学院广西水牛研究所,广西 南宁 530001; 3.广西医科大学医学科学实验中心,广西 南宁 530001)     摘要:  为阐明广西沼泽型水牛Sohlh2基因在水牛不同组织中的表达规律,根据GenBank 已公布的牛Sohlh2 基因序列,设计其编码区(CDS)扩增引物,应用RT⁃PCR方法扩增克隆获得目的基因片段;应用生物信息学方法,系 统分析了水牛Sohlh2 的遗传进化以及蛋白质的理化性质、二级和三级结构;并应用RT⁃QPCR技术对Sohlh2基因在 水牛组织(器官)的表达进行了分析。 结果表明:水牛Sohlh2基因编码区全长 1281bp,共编码426个氨基酸。 多 重序列比较分析结果显示水牛Sohlh2 核苷酸序列与牛、绵羊、山羊、猪、马、人和小鼠相应序列的相似性分别为 98%、96%、96%、85%、86%、81%和72%,系统进化树显示Sohlh2基因在不同物种以及进化的过程中具有高度保守 性。 Sohlh2蛋白质呈弱碱性,无信号肽,在细胞中亚定位于细胞核中,存在bHLH结构。 水牛Sohlh2基因在水牛垂 体、大脑、肝脏、骨骼、卵巢和睾丸等11个组织(器官)细胞中具有不同程度的表达,其中睾丸细胞中表达量最高,垂 体和生殖脊细胞中表达量次之,卵丘细胞中表达量低,心脏、肺脏、肌肉细胞和颗粒细胞中不表达。 关键词:  水牛; Sohlh2基因; 克隆分析; 表达 + 中图分类号:  S823.8 3      文献标识码:  A      文章编号:  1000⁃4440(2016)02⁃0399⁃09 Cloning and expression pattern of buffalo Sohlh2 gene 1,2 1 1 1,3 1 1 ZHU Peng ,  CHEN Ji⁃cheng ,  CHEN Feng ,  SU Jie ,  LI Hai⁃yang ,  WEI Ying⁃ming ,  1 1 YANG Su⁃fang ,  SHI De⁃shun (1.StateKey Laboratoryfor Conservationand Utilizationof SubtropicalAgro⁃bioresources,Guangxi University,Nanning530005,China; 2.GuangxiBuffa⁃ lo ResearchInstitute,ChineseAcademy of AgriculturalScience,Nanning 530001,China; 3.MedicalScientificResearch Centre,GuangxiMedical Universi⁃ ty,Nanning 530001,China)     Abstract:  To identify the expression pattern of

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